Protein–RNA interactions for Protein: O35261

E2f3, Transcription factor E2F3, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f3O35261 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
E2f3O35261 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
E2f3O35261 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
E2f3O35261 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
E2f3O35261 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
E2f3O35261 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
E2f3O35261 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
E2f3O35261 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
E2f3O35261 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
E2f3O35261 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
E2f3O35261 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
E2f3O35261 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
E2f3O35261 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
E2f3O35261 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
E2f3O35261 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
E2f3O35261 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
E2f3O35261 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
E2f3O35261 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
E2f3O35261 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
E2f3O35261 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
E2f3O35261 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
E2f3O35261 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
E2f3O35261 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
E2f3O35261 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
E2f3O35261 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
E2f3O35261 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
E2f3O35261 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
E2f3O35261 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
E2f3O35261 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
E2f3O35261 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
E2f3O35261 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
E2f3O35261 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
E2f3O35261 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
E2f3O35261 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
E2f3O35261 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
E2f3O35261 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
E2f3O35261 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
E2f3O35261 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
E2f3O35261 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
E2f3O35261 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
E2f3O35261 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
E2f3O35261 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
E2f3O35261 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
E2f3O35261 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
E2f3O35261 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
E2f3O35261 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
E2f3O35261 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
E2f3O35261 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
E2f3O35261 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
E2f3O35261 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
E2f3O35261 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
E2f3O35261 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
E2f3O35261 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
E2f3O35261 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
E2f3O35261 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
E2f3O35261 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
E2f3O35261 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
E2f3O35261 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
E2f3O35261 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
E2f3O35261 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
E2f3O35261 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
E2f3O35261 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
E2f3O35261 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
E2f3O35261 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
E2f3O35261 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
E2f3O35261 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
E2f3O35261 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
E2f3O35261 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
E2f3O35261 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
E2f3O35261 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
E2f3O35261 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
E2f3O35261 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
E2f3O35261 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
E2f3O35261 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
E2f3O35261 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
E2f3O35261 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
E2f3O35261 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
E2f3O35261 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
E2f3O35261 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
E2f3O35261 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
E2f3O35261 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
E2f3O35261 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
E2f3O35261 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
E2f3O35261 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
E2f3O35261 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
E2f3O35261 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
E2f3O35261 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
E2f3O35261 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
E2f3O35261 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
E2f3O35261 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
E2f3O35261 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
E2f3O35261 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
E2f3O35261 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
E2f3O35261 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
E2f3O35261 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
E2f3O35261 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
E2f3O35261 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
E2f3O35261 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
E2f3O35261 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
E2f3O35261 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms