Protein–RNA interactions for Protein: O35239

Ptpn9, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 9, mousemouse

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Length 593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ptpn9O35239 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ptpn9O35239 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
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Ptpn9O35239 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
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Ptpn9O35239 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ptpn9O35239 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ptpn9O35239 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ptpn9O35239 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ptpn9O35239 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ptpn9O35239 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
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Ptpn9O35239 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ptpn9O35239 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
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Ptpn9O35239 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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Ptpn9O35239 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms