Protein–RNA interactions for Protein: O35228

Ebi3, Interleukin-27 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebi3O35228 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ebi3O35228 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ebi3O35228 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ebi3O35228 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ebi3O35228 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ebi3O35228 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ebi3O35228 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ebi3O35228 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ebi3O35228 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ebi3O35228 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ebi3O35228 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ebi3O35228 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ebi3O35228 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ebi3O35228 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ebi3O35228 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ebi3O35228 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ebi3O35228 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ebi3O35228 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ebi3O35228 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ebi3O35228 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ebi3O35228 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ebi3O35228 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ebi3O35228 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ebi3O35228 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ebi3O35228 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ebi3O35228 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ebi3O35228 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ebi3O35228 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ebi3O35228 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ebi3O35228 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ebi3O35228 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ebi3O35228 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ebi3O35228 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ebi3O35228 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ebi3O35228 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ebi3O35228 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ebi3O35228 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ebi3O35228 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ebi3O35228 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ebi3O35228 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ebi3O35228 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ebi3O35228 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ebi3O35228 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ebi3O35228 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ebi3O35228 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ebi3O35228 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ebi3O35228 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ebi3O35228 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ebi3O35228 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ebi3O35228 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ebi3O35228 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ebi3O35228 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ebi3O35228 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ebi3O35228 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ebi3O35228 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ebi3O35228 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ebi3O35228 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ebi3O35228 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ebi3O35228 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ebi3O35228 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ebi3O35228 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ebi3O35228 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ebi3O35228 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ebi3O35228 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Ebi3O35228 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ebi3O35228 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Ebi3O35228 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ebi3O35228 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ebi3O35228 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ebi3O35228 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ebi3O35228 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ebi3O35228 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ebi3O35228 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ebi3O35228 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ebi3O35228 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ebi3O35228 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ebi3O35228 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ebi3O35228 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ebi3O35228 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ebi3O35228 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ebi3O35228 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ebi3O35228 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ebi3O35228 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ebi3O35228 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ebi3O35228 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ebi3O35228 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ebi3O35228 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ebi3O35228 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ebi3O35228 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ebi3O35228 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ebi3O35228 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ebi3O35228 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ebi3O35228 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Ebi3O35228 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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