Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ArxO35085 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ArxO35085 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ArxO35085 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ArxO35085 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ArxO35085 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ArxO35085 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ArxO35085 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ArxO35085 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ArxO35085 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ArxO35085 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ArxO35085 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ArxO35085 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ArxO35085 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ArxO35085 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ArxO35085 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ArxO35085 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ArxO35085 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ArxO35085 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ArxO35085 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ArxO35085 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ArxO35085 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ArxO35085 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ArxO35085 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ArxO35085 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ArxO35085 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ArxO35085 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ArxO35085 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ArxO35085 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ArxO35085 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ArxO35085 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ArxO35085 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ArxO35085 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ArxO35085 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ArxO35085 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ArxO35085 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ArxO35085 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ArxO35085 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ArxO35085 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ArxO35085 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ArxO35085 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ArxO35085 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ArxO35085 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ArxO35085 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ArxO35085 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ArxO35085 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ArxO35085 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ArxO35085 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ArxO35085 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ArxO35085 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ArxO35085 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ArxO35085 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ArxO35085 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ArxO35085 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ArxO35085 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ArxO35085 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ArxO35085 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ArxO35085 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ArxO35085 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ArxO35085 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ArxO35085 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ArxO35085 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ArxO35085 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ArxO35085 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ArxO35085 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ArxO35085 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ArxO35085 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ArxO35085 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ArxO35085 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ArxO35085 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ArxO35085 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ArxO35085 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ArxO35085 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ArxO35085 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ArxO35085 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ArxO35085 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ArxO35085 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ArxO35085 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ArxO35085 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ArxO35085 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ArxO35085 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ArxO35085 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ArxO35085 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ArxO35085 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ArxO35085 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ArxO35085 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ArxO35085 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ArxO35085 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ArxO35085 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ArxO35085 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ArxO35085 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ArxO35085 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ArxO35085 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ArxO35085 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ArxO35085 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ArxO35085 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ArxO35085 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ArxO35085 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ArxO35085 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ArxO35085 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms