Protein–RNA interactions for Protein: O08786

Cckar, Cholecystokinin receptor type A, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckarO08786 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CckarO08786 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CckarO08786 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CckarO08786 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CckarO08786 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CckarO08786 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CckarO08786 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CckarO08786 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CckarO08786 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CckarO08786 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CckarO08786 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CckarO08786 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CckarO08786 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CckarO08786 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CckarO08786 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CckarO08786 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CckarO08786 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CckarO08786 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CckarO08786 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CckarO08786 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CckarO08786 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CckarO08786 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CckarO08786 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CckarO08786 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CckarO08786 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CckarO08786 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CckarO08786 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CckarO08786 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CckarO08786 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CckarO08786 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CckarO08786 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CckarO08786 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CckarO08786 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CckarO08786 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CckarO08786 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CckarO08786 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CckarO08786 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CckarO08786 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CckarO08786 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CckarO08786 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CckarO08786 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CckarO08786 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CckarO08786 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CckarO08786 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CckarO08786 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CckarO08786 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CckarO08786 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CckarO08786 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CckarO08786 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CckarO08786 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CckarO08786 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CckarO08786 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CckarO08786 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CckarO08786 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CckarO08786 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CckarO08786 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CckarO08786 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CckarO08786 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CckarO08786 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CckarO08786 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CckarO08786 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CckarO08786 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CckarO08786 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CckarO08786 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CckarO08786 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CckarO08786 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CckarO08786 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CckarO08786 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CckarO08786 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CckarO08786 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CckarO08786 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CckarO08786 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CckarO08786 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CckarO08786 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CckarO08786 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CckarO08786 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CckarO08786 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CckarO08786 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CckarO08786 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CckarO08786 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CckarO08786 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CckarO08786 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CckarO08786 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CckarO08786 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CckarO08786 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CckarO08786 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CckarO08786 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CckarO08786 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CckarO08786 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CckarO08786 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CckarO08786 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CckarO08786 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CckarO08786 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CckarO08786 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CckarO08786 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CckarO08786 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CckarO08786 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CckarO08786 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CckarO08786 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CckarO08786 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms