Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

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Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MttpO08601 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MttpO08601 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MttpO08601 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MttpO08601 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MttpO08601 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MttpO08601 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MttpO08601 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
MttpO08601 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
MttpO08601 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MttpO08601 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MttpO08601 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
MttpO08601 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MttpO08601 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MttpO08601 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MttpO08601 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MttpO08601 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
MttpO08601 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MttpO08601 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
MttpO08601 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MttpO08601 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MttpO08601 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MttpO08601 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MttpO08601 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MttpO08601 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MttpO08601 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MttpO08601 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MttpO08601 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MttpO08601 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MttpO08601 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
MttpO08601 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MttpO08601 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MttpO08601 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MttpO08601 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
MttpO08601 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MttpO08601 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MttpO08601 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MttpO08601 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MttpO08601 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MttpO08601 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
MttpO08601 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MttpO08601 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
MttpO08601 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MttpO08601 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MttpO08601 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MttpO08601 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MttpO08601 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MttpO08601 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
MttpO08601 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MttpO08601 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MttpO08601 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MttpO08601 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MttpO08601 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MttpO08601 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
MttpO08601 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
MttpO08601 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MttpO08601 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MttpO08601 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MttpO08601 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MttpO08601 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
MttpO08601 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
MttpO08601 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MttpO08601 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MttpO08601 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MttpO08601 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MttpO08601 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
MttpO08601 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
MttpO08601 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
MttpO08601 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
MttpO08601 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
MttpO08601 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
MttpO08601 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
MttpO08601 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
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MttpO08601 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
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MttpO08601 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MttpO08601 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MttpO08601 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
MttpO08601 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MttpO08601 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MttpO08601 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MttpO08601 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MttpO08601 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MttpO08601 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MttpO08601 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MttpO08601 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
MttpO08601 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
MttpO08601 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
MttpO08601 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MttpO08601 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MttpO08601 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
MttpO08601 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MttpO08601 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MttpO08601 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
MttpO08601 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
MttpO08601 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MttpO08601 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
MttpO08601 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
MttpO08601 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms