Protein–RNA interactions for Protein: L7N232

Zfp955b, Zinc finger protein 955B, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp955bL7N232 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zfp955bL7N232 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zfp955bL7N232 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zfp955bL7N232 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Zfp955bL7N232 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zfp955bL7N232 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zfp955bL7N232 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zfp955bL7N232 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zfp955bL7N232 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zfp955bL7N232 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zfp955bL7N232 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zfp955bL7N232 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zfp955bL7N232 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zfp955bL7N232 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zfp955bL7N232 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zfp955bL7N232 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zfp955bL7N232 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zfp955bL7N232 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zfp955bL7N232 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zfp955bL7N232 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zfp955bL7N232 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zfp955bL7N232 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zfp955bL7N232 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zfp955bL7N232 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zfp955bL7N232 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zfp955bL7N232 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zfp955bL7N232 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zfp955bL7N232 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zfp955bL7N232 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zfp955bL7N232 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zfp955bL7N232 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zfp955bL7N232 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zfp955bL7N232 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zfp955bL7N232 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zfp955bL7N232 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Zfp955bL7N232 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zfp955bL7N232 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zfp955bL7N232 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Zfp955bL7N232 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Zfp955bL7N232 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Zfp955bL7N232 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Zfp955bL7N232 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Zfp955bL7N232 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zfp955bL7N232 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zfp955bL7N232 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zfp955bL7N232 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zfp955bL7N232 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zfp955bL7N232 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Zfp955bL7N232 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zfp955bL7N232 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zfp955bL7N232 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zfp955bL7N232 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zfp955bL7N232 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zfp955bL7N232 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zfp955bL7N232 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zfp955bL7N232 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zfp955bL7N232 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zfp955bL7N232 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zfp955bL7N232 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zfp955bL7N232 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zfp955bL7N232 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zfp955bL7N232 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Zfp955bL7N232 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zfp955bL7N232 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zfp955bL7N232 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zfp955bL7N232 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zfp955bL7N232 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zfp955bL7N232 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zfp955bL7N232 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zfp955bL7N232 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zfp955bL7N232 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zfp955bL7N232 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zfp955bL7N232 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zfp955bL7N232 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zfp955bL7N232 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zfp955bL7N232 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zfp955bL7N232 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zfp955bL7N232 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zfp955bL7N232 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zfp955bL7N232 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zfp955bL7N232 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zfp955bL7N232 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zfp955bL7N232 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zfp955bL7N232 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zfp955bL7N232 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zfp955bL7N232 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zfp955bL7N232 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zfp955bL7N232 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zfp955bL7N232 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Zfp955bL7N232 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zfp955bL7N232 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zfp955bL7N232 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zfp955bL7N232 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zfp955bL7N232 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zfp955bL7N232 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zfp955bL7N232 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zfp955bL7N232 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zfp955bL7N232 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zfp955bL7N232 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zfp955bL7N232 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms