Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smim18J3QNP2 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smim18J3QNP2 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smim18J3QNP2 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smim18J3QNP2 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smim18J3QNP2 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smim18J3QNP2 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Smim18J3QNP2 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smim18J3QNP2 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smim18J3QNP2 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smim18J3QNP2 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smim18J3QNP2 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smim18J3QNP2 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smim18J3QNP2 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smim18J3QNP2 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smim18J3QNP2 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smim18J3QNP2 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smim18J3QNP2 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smim18J3QNP2 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smim18J3QNP2 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smim18J3QNP2 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smim18J3QNP2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Smim18J3QNP2 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smim18J3QNP2 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smim18J3QNP2 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smim18J3QNP2 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smim18J3QNP2 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smim18J3QNP2 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smim18J3QNP2 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smim18J3QNP2 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smim18J3QNP2 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smim18J3QNP2 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smim18J3QNP2 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smim18J3QNP2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smim18J3QNP2 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smim18J3QNP2 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smim18J3QNP2 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smim18J3QNP2 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smim18J3QNP2 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smim18J3QNP2 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smim18J3QNP2 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smim18J3QNP2 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smim18J3QNP2 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smim18J3QNP2 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smim18J3QNP2 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Smim18J3QNP2 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Smim18J3QNP2 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smim18J3QNP2 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smim18J3QNP2 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smim18J3QNP2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smim18J3QNP2 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smim18J3QNP2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smim18J3QNP2 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smim18J3QNP2 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smim18J3QNP2 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smim18J3QNP2 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Smim18J3QNP2 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smim18J3QNP2 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smim18J3QNP2 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Smim18J3QNP2 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smim18J3QNP2 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smim18J3QNP2 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smim18J3QNP2 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smim18J3QNP2 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smim18J3QNP2 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smim18J3QNP2 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smim18J3QNP2 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smim18J3QNP2 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smim18J3QNP2 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smim18J3QNP2 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smim18J3QNP2 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smim18J3QNP2 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smim18J3QNP2 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smim18J3QNP2 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smim18J3QNP2 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smim18J3QNP2 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smim18J3QNP2 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smim18J3QNP2 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smim18J3QNP2 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smim18J3QNP2 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smim18J3QNP2 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smim18J3QNP2 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smim18J3QNP2 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smim18J3QNP2 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smim18J3QNP2 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smim18J3QNP2 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smim18J3QNP2 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smim18J3QNP2 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smim18J3QNP2 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Smim18J3QNP2 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smim18J3QNP2 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smim18J3QNP2 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smim18J3QNP2 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smim18J3QNP2 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smim18J3QNP2 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smim18J3QNP2 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smim18J3QNP2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smim18J3QNP2 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smim18J3QNP2 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smim18J3QNP2 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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