Protein–RNA interactions for Protein: J3QN38

Gm21972, Predicted gene 21972 (Fragment), mousemouse

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Length 98 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21972J3QN38 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm21972J3QN38 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm21972J3QN38 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm21972J3QN38 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm21972J3QN38 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm21972J3QN38 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm21972J3QN38 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm21972J3QN38 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm21972J3QN38 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm21972J3QN38 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm21972J3QN38 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm21972J3QN38 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm21972J3QN38 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm21972J3QN38 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm21972J3QN38 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm21972J3QN38 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm21972J3QN38 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm21972J3QN38 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm21972J3QN38 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm21972J3QN38 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm21972J3QN38 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm21972J3QN38 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm21972J3QN38 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm21972J3QN38 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm21972J3QN38 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm21972J3QN38 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm21972J3QN38 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm21972J3QN38 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Gm21972J3QN38 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm21972J3QN38 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm21972J3QN38 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm21972J3QN38 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Gm21972J3QN38 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm21972J3QN38 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Gm21972J3QN38 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm21972J3QN38 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Gm21972J3QN38 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Gm21972J3QN38 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Gm21972J3QN38 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Gm21972J3QN38 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm21972J3QN38 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Gm21972J3QN38 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm21972J3QN38 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm21972J3QN38 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Gm21972J3QN38 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm21972J3QN38 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Gm21972J3QN38 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm21972J3QN38 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Gm21972J3QN38 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Gm21972J3QN38 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Gm21972J3QN38 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm21972J3QN38 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm21972J3QN38 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm21972J3QN38 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm21972J3QN38 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm21972J3QN38 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm21972J3QN38 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm21972J3QN38 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm21972J3QN38 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm21972J3QN38 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm21972J3QN38 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm21972J3QN38 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm21972J3QN38 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm21972J3QN38 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm21972J3QN38 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm21972J3QN38 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm21972J3QN38 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm21972J3QN38 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm21972J3QN38 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm21972J3QN38 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm21972J3QN38 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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