Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm21818J3KMS6 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm21818J3KMS6 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm21818J3KMS6 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm21818J3KMS6 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm21818J3KMS6 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm21818J3KMS6 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm21818J3KMS6 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm21818J3KMS6 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm21818J3KMS6 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm21818J3KMS6 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm21818J3KMS6 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm21818J3KMS6 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm21818J3KMS6 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm21818J3KMS6 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm21818J3KMS6 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm21818J3KMS6 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm21818J3KMS6 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm21818J3KMS6 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm21818J3KMS6 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm21818J3KMS6 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm21818J3KMS6 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm21818J3KMS6 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm21818J3KMS6 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm21818J3KMS6 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm21818J3KMS6 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm21818J3KMS6 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm21818J3KMS6 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm21818J3KMS6 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm21818J3KMS6 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm21818J3KMS6 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm21818J3KMS6 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm21818J3KMS6 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm21818J3KMS6 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm21818J3KMS6 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm21818J3KMS6 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm21818J3KMS6 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm21818J3KMS6 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm21818J3KMS6 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm21818J3KMS6 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm21818J3KMS6 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm21818J3KMS6 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm21818J3KMS6 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm21818J3KMS6 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm21818J3KMS6 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm21818J3KMS6 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm21818J3KMS6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm21818J3KMS6 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm21818J3KMS6 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm21818J3KMS6 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm21818J3KMS6 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm21818J3KMS6 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm21818J3KMS6 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm21818J3KMS6 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm21818J3KMS6 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm21818J3KMS6 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm21818J3KMS6 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm21818J3KMS6 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm21818J3KMS6 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm21818J3KMS6 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm21818J3KMS6 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
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Gm21818J3KMS6 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm21818J3KMS6 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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Gm21818J3KMS6 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm21818J3KMS6 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm21818J3KMS6 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm21818J3KMS6 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm21818J3KMS6 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm21818J3KMS6 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm21818J3KMS6 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm21818J3KMS6 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm21818J3KMS6 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm21818J3KMS6 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm21818J3KMS6 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm21818J3KMS6 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm21818J3KMS6 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm21818J3KMS6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm21818J3KMS6 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm21818J3KMS6 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm21818J3KMS6 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm21818J3KMS6 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm21818J3KMS6 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm21818J3KMS6 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm21818J3KMS6 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm21818J3KMS6 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm21818J3KMS6 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm21818J3KMS6 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm21818J3KMS6 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm21818J3KMS6 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm21818J3KMS6 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm21818J3KMS6 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm21818J3KMS6 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm21818J3KMS6 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm21818J3KMS6 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21818J3KMS6 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21818J3KMS6 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21818J3KMS6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21818J3KMS6 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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