Protein–RNA interactions for Protein: G5E8I7

Usp17lc, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein C, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17lcG5E8I7 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp17lcG5E8I7 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp17lcG5E8I7 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp17lcG5E8I7 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp17lcG5E8I7 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp17lcG5E8I7 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp17lcG5E8I7 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp17lcG5E8I7 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp17lcG5E8I7 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp17lcG5E8I7 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp17lcG5E8I7 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp17lcG5E8I7 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp17lcG5E8I7 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp17lcG5E8I7 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp17lcG5E8I7 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Usp17lcG5E8I7 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Usp17lcG5E8I7 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Usp17lcG5E8I7 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Usp17lcG5E8I7 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Usp17lcG5E8I7 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp17lcG5E8I7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp17lcG5E8I7 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp17lcG5E8I7 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp17lcG5E8I7 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp17lcG5E8I7 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp17lcG5E8I7 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp17lcG5E8I7 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp17lcG5E8I7 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp17lcG5E8I7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp17lcG5E8I7 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp17lcG5E8I7 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp17lcG5E8I7 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp17lcG5E8I7 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp17lcG5E8I7 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp17lcG5E8I7 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp17lcG5E8I7 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp17lcG5E8I7 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp17lcG5E8I7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp17lcG5E8I7 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp17lcG5E8I7 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp17lcG5E8I7 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp17lcG5E8I7 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp17lcG5E8I7 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp17lcG5E8I7 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp17lcG5E8I7 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp17lcG5E8I7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp17lcG5E8I7 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp17lcG5E8I7 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp17lcG5E8I7 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp17lcG5E8I7 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp17lcG5E8I7 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp17lcG5E8I7 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp17lcG5E8I7 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp17lcG5E8I7 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp17lcG5E8I7 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp17lcG5E8I7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp17lcG5E8I7 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp17lcG5E8I7 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp17lcG5E8I7 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp17lcG5E8I7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp17lcG5E8I7 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp17lcG5E8I7 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp17lcG5E8I7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp17lcG5E8I7 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp17lcG5E8I7 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp17lcG5E8I7 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp17lcG5E8I7 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp17lcG5E8I7 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp17lcG5E8I7 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp17lcG5E8I7 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp17lcG5E8I7 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp17lcG5E8I7 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp17lcG5E8I7 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp17lcG5E8I7 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp17lcG5E8I7 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp17lcG5E8I7 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp17lcG5E8I7 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp17lcG5E8I7 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp17lcG5E8I7 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp17lcG5E8I7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp17lcG5E8I7 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp17lcG5E8I7 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp17lcG5E8I7 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp17lcG5E8I7 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp17lcG5E8I7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp17lcG5E8I7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp17lcG5E8I7 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp17lcG5E8I7 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp17lcG5E8I7 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp17lcG5E8I7 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp17lcG5E8I7 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp17lcG5E8I7 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp17lcG5E8I7 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp17lcG5E8I7 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp17lcG5E8I7 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp17lcG5E8I7 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp17lcG5E8I7 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp17lcG5E8I7 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp17lcG5E8I7 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp17lcG5E8I7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms