Protein–RNA interactions for Protein: G5E829

Atp2b1, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b1G5E829 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp2b1G5E829 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp2b1G5E829 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp2b1G5E829 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atp2b1G5E829 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atp2b1G5E829 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atp2b1G5E829 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atp2b1G5E829 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atp2b1G5E829 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atp2b1G5E829 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atp2b1G5E829 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Atp2b1G5E829 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atp2b1G5E829 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atp2b1G5E829 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atp2b1G5E829 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atp2b1G5E829 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atp2b1G5E829 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atp2b1G5E829 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atp2b1G5E829 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atp2b1G5E829 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atp2b1G5E829 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp2b1G5E829 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp2b1G5E829 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp2b1G5E829 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp2b1G5E829 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp2b1G5E829 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp2b1G5E829 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp2b1G5E829 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp2b1G5E829 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp2b1G5E829 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp2b1G5E829 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp2b1G5E829 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp2b1G5E829 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp2b1G5E829 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp2b1G5E829 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp2b1G5E829 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp2b1G5E829 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp2b1G5E829 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp2b1G5E829 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp2b1G5E829 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp2b1G5E829 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp2b1G5E829 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp2b1G5E829 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp2b1G5E829 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp2b1G5E829 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp2b1G5E829 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp2b1G5E829 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp2b1G5E829 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp2b1G5E829 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp2b1G5E829 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp2b1G5E829 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp2b1G5E829 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp2b1G5E829 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp2b1G5E829 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp2b1G5E829 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp2b1G5E829 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp2b1G5E829 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp2b1G5E829 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp2b1G5E829 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp2b1G5E829 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp2b1G5E829 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp2b1G5E829 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp2b1G5E829 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp2b1G5E829 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp2b1G5E829 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp2b1G5E829 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp2b1G5E829 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp2b1G5E829 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp2b1G5E829 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp2b1G5E829 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp2b1G5E829 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp2b1G5E829 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp2b1G5E829 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp2b1G5E829 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp2b1G5E829 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp2b1G5E829 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp2b1G5E829 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp2b1G5E829 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp2b1G5E829 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp2b1G5E829 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp2b1G5E829 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp2b1G5E829 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp2b1G5E829 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp2b1G5E829 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp2b1G5E829 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp2b1G5E829 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp2b1G5E829 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp2b1G5E829 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp2b1G5E829 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp2b1G5E829 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp2b1G5E829 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp2b1G5E829 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp2b1G5E829 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp2b1G5E829 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp2b1G5E829 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp2b1G5E829 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp2b1G5E829 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp2b1G5E829 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp2b1G5E829 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp2b1G5E829 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms