Protein–RNA interactions for Protein: G3X9K3

Arfgef1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef1G3X9K3 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Arfgef1G3X9K3 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Arfgef1G3X9K3 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Arfgef1G3X9K3 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Arfgef1G3X9K3 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Arfgef1G3X9K3 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Arfgef1G3X9K3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Arfgef1G3X9K3 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Arfgef1G3X9K3 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Arfgef1G3X9K3 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Arfgef1G3X9K3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Arfgef1G3X9K3 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Arfgef1G3X9K3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Arfgef1G3X9K3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Arfgef1G3X9K3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Arfgef1G3X9K3 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Arfgef1G3X9K3 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Arfgef1G3X9K3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Arfgef1G3X9K3 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Arfgef1G3X9K3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Arfgef1G3X9K3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Arfgef1G3X9K3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Arfgef1G3X9K3 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Arfgef1G3X9K3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Arfgef1G3X9K3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Arfgef1G3X9K3 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Arfgef1G3X9K3 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Arfgef1G3X9K3 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Arfgef1G3X9K3 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Arfgef1G3X9K3 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Arfgef1G3X9K3 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Arfgef1G3X9K3 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Arfgef1G3X9K3 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Arfgef1G3X9K3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Arfgef1G3X9K3 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Arfgef1G3X9K3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Arfgef1G3X9K3 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Arfgef1G3X9K3 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Arfgef1G3X9K3 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Arfgef1G3X9K3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Arfgef1G3X9K3 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Arfgef1G3X9K3 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Arfgef1G3X9K3 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Arfgef1G3X9K3 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Arfgef1G3X9K3 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Arfgef1G3X9K3 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Arfgef1G3X9K3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Arfgef1G3X9K3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Arfgef1G3X9K3 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Arfgef1G3X9K3 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Arfgef1G3X9K3 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Arfgef1G3X9K3 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Arfgef1G3X9K3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Arfgef1G3X9K3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Arfgef1G3X9K3 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Arfgef1G3X9K3 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Arfgef1G3X9K3 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Arfgef1G3X9K3 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Arfgef1G3X9K3 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Arfgef1G3X9K3 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Arfgef1G3X9K3 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Arfgef1G3X9K3 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Arfgef1G3X9K3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Arfgef1G3X9K3 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Arfgef1G3X9K3 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Arfgef1G3X9K3 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Arfgef1G3X9K3 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Arfgef1G3X9K3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Arfgef1G3X9K3 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Arfgef1G3X9K3 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Arfgef1G3X9K3 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Arfgef1G3X9K3 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Arfgef1G3X9K3 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Arfgef1G3X9K3 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Arfgef1G3X9K3 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Arfgef1G3X9K3 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Arfgef1G3X9K3 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Arfgef1G3X9K3 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Arfgef1G3X9K3 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Arfgef1G3X9K3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Arfgef1G3X9K3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Arfgef1G3X9K3 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Arfgef1G3X9K3 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Arfgef1G3X9K3 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Arfgef1G3X9K3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Arfgef1G3X9K3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Arfgef1G3X9K3 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Arfgef1G3X9K3 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Arfgef1G3X9K3 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Arfgef1G3X9K3 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Arfgef1G3X9K3 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Arfgef1G3X9K3 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Arfgef1G3X9K3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Arfgef1G3X9K3 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Arfgef1G3X9K3 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Arfgef1G3X9K3 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Arfgef1G3X9K3 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Arfgef1G3X9K3 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Arfgef1G3X9K3 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Arfgef1G3X9K3 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms