Protein–RNA interactions for Protein: G3X9F6

Sh3tc1, SH3 domain and tetratricopeptide repeats 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3tc1G3X9F6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sh3tc1G3X9F6 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sh3tc1G3X9F6 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sh3tc1G3X9F6 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Sh3tc1G3X9F6 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sh3tc1G3X9F6 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sh3tc1G3X9F6 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sh3tc1G3X9F6 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sh3tc1G3X9F6 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sh3tc1G3X9F6 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Sh3tc1G3X9F6 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sh3tc1G3X9F6 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sh3tc1G3X9F6 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sh3tc1G3X9F6 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sh3tc1G3X9F6 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sh3tc1G3X9F6 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sh3tc1G3X9F6 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sh3tc1G3X9F6 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sh3tc1G3X9F6 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sh3tc1G3X9F6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Sh3tc1G3X9F6 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sh3tc1G3X9F6 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sh3tc1G3X9F6 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sh3tc1G3X9F6 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sh3tc1G3X9F6 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sh3tc1G3X9F6 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sh3tc1G3X9F6 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sh3tc1G3X9F6 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Sh3tc1G3X9F6 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sh3tc1G3X9F6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sh3tc1G3X9F6 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sh3tc1G3X9F6 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sh3tc1G3X9F6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sh3tc1G3X9F6 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sh3tc1G3X9F6 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sh3tc1G3X9F6 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sh3tc1G3X9F6 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sh3tc1G3X9F6 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sh3tc1G3X9F6 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sh3tc1G3X9F6 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sh3tc1G3X9F6 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sh3tc1G3X9F6 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sh3tc1G3X9F6 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sh3tc1G3X9F6 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Sh3tc1G3X9F6 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sh3tc1G3X9F6 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sh3tc1G3X9F6 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sh3tc1G3X9F6 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sh3tc1G3X9F6 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sh3tc1G3X9F6 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sh3tc1G3X9F6 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sh3tc1G3X9F6 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sh3tc1G3X9F6 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sh3tc1G3X9F6 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sh3tc1G3X9F6 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sh3tc1G3X9F6 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sh3tc1G3X9F6 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sh3tc1G3X9F6 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sh3tc1G3X9F6 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sh3tc1G3X9F6 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sh3tc1G3X9F6 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sh3tc1G3X9F6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sh3tc1G3X9F6 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sh3tc1G3X9F6 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sh3tc1G3X9F6 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sh3tc1G3X9F6 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sh3tc1G3X9F6 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sh3tc1G3X9F6 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Sh3tc1G3X9F6 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sh3tc1G3X9F6 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sh3tc1G3X9F6 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sh3tc1G3X9F6 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sh3tc1G3X9F6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sh3tc1G3X9F6 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sh3tc1G3X9F6 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sh3tc1G3X9F6 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sh3tc1G3X9F6 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sh3tc1G3X9F6 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sh3tc1G3X9F6 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sh3tc1G3X9F6 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sh3tc1G3X9F6 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sh3tc1G3X9F6 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sh3tc1G3X9F6 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sh3tc1G3X9F6 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sh3tc1G3X9F6 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Sh3tc1G3X9F6 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sh3tc1G3X9F6 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Sh3tc1G3X9F6 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Sh3tc1G3X9F6 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sh3tc1G3X9F6 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sh3tc1G3X9F6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sh3tc1G3X9F6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sh3tc1G3X9F6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sh3tc1G3X9F6 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Sh3tc1G3X9F6 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sh3tc1G3X9F6 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sh3tc1G3X9F6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sh3tc1G3X9F6 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sh3tc1G3X9F6 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sh3tc1G3X9F6 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms