Protein–RNA interactions for Protein: G3X9C2

Nccrp1, F-box only protein 50, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nccrp1G3X9C2 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nccrp1G3X9C2 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nccrp1G3X9C2 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nccrp1G3X9C2 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nccrp1G3X9C2 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nccrp1G3X9C2 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nccrp1G3X9C2 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nccrp1G3X9C2 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nccrp1G3X9C2 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nccrp1G3X9C2 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nccrp1G3X9C2 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nccrp1G3X9C2 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nccrp1G3X9C2 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nccrp1G3X9C2 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nccrp1G3X9C2 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nccrp1G3X9C2 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nccrp1G3X9C2 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nccrp1G3X9C2 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nccrp1G3X9C2 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nccrp1G3X9C2 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nccrp1G3X9C2 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nccrp1G3X9C2 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nccrp1G3X9C2 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nccrp1G3X9C2 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nccrp1G3X9C2 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nccrp1G3X9C2 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nccrp1G3X9C2 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nccrp1G3X9C2 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nccrp1G3X9C2 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nccrp1G3X9C2 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nccrp1G3X9C2 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nccrp1G3X9C2 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nccrp1G3X9C2 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nccrp1G3X9C2 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nccrp1G3X9C2 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nccrp1G3X9C2 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nccrp1G3X9C2 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nccrp1G3X9C2 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nccrp1G3X9C2 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nccrp1G3X9C2 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nccrp1G3X9C2 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nccrp1G3X9C2 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nccrp1G3X9C2 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nccrp1G3X9C2 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nccrp1G3X9C2 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nccrp1G3X9C2 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nccrp1G3X9C2 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nccrp1G3X9C2 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nccrp1G3X9C2 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nccrp1G3X9C2 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nccrp1G3X9C2 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nccrp1G3X9C2 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nccrp1G3X9C2 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nccrp1G3X9C2 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nccrp1G3X9C2 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nccrp1G3X9C2 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nccrp1G3X9C2 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Nccrp1G3X9C2 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Nccrp1G3X9C2 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nccrp1G3X9C2 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nccrp1G3X9C2 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nccrp1G3X9C2 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nccrp1G3X9C2 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Nccrp1G3X9C2 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nccrp1G3X9C2 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nccrp1G3X9C2 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nccrp1G3X9C2 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nccrp1G3X9C2 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nccrp1G3X9C2 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nccrp1G3X9C2 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nccrp1G3X9C2 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nccrp1G3X9C2 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nccrp1G3X9C2 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nccrp1G3X9C2 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nccrp1G3X9C2 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nccrp1G3X9C2 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nccrp1G3X9C2 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nccrp1G3X9C2 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nccrp1G3X9C2 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nccrp1G3X9C2 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nccrp1G3X9C2 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nccrp1G3X9C2 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nccrp1G3X9C2 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nccrp1G3X9C2 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nccrp1G3X9C2 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nccrp1G3X9C2 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nccrp1G3X9C2 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nccrp1G3X9C2 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nccrp1G3X9C2 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nccrp1G3X9C2 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nccrp1G3X9C2 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nccrp1G3X9C2 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nccrp1G3X9C2 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nccrp1G3X9C2 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nccrp1G3X9C2 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nccrp1G3X9C2 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nccrp1G3X9C2 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nccrp1G3X9C2 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nccrp1G3X9C2 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nccrp1G3X9C2 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 260.5 ms