Protein–RNA interactions for Protein: G3X939

Slc9a3, Sodium/hydrogen exchanger 3, mousemouse

Predictions only

Length 829 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a3G3X939 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Slc9a3G3X939 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Slc9a3G3X939 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Slc9a3G3X939 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Slc9a3G3X939 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Slc9a3G3X939 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Slc9a3G3X939 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Slc9a3G3X939 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Slc9a3G3X939 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Slc9a3G3X939 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Slc9a3G3X939 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Slc9a3G3X939 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Slc9a3G3X939 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Slc9a3G3X939 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Slc9a3G3X939 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Slc9a3G3X939 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Slc9a3G3X939 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Slc9a3G3X939 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Slc9a3G3X939 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Slc9a3G3X939 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Slc9a3G3X939 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Slc9a3G3X939 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Slc9a3G3X939 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Slc9a3G3X939 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Slc9a3G3X939 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Slc9a3G3X939 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Slc9a3G3X939 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Slc9a3G3X939 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Slc9a3G3X939 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Slc9a3G3X939 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Slc9a3G3X939 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Slc9a3G3X939 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Slc9a3G3X939 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Slc9a3G3X939 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Slc9a3G3X939 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Slc9a3G3X939 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Slc9a3G3X939 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Slc9a3G3X939 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Slc9a3G3X939 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Slc9a3G3X939 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Slc9a3G3X939 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Slc9a3G3X939 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc9a3G3X939 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc9a3G3X939 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc9a3G3X939 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc9a3G3X939 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc9a3G3X939 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc9a3G3X939 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc9a3G3X939 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc9a3G3X939 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc9a3G3X939 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc9a3G3X939 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc9a3G3X939 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc9a3G3X939 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc9a3G3X939 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc9a3G3X939 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc9a3G3X939 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc9a3G3X939 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc9a3G3X939 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc9a3G3X939 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc9a3G3X939 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc9a3G3X939 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc9a3G3X939 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc9a3G3X939 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc9a3G3X939 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc9a3G3X939 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc9a3G3X939 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc9a3G3X939 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc9a3G3X939 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc9a3G3X939 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc9a3G3X939 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Slc9a3G3X939 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slc9a3G3X939 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slc9a3G3X939 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slc9a3G3X939 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slc9a3G3X939 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slc9a3G3X939 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slc9a3G3X939 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slc9a3G3X939 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slc9a3G3X939 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slc9a3G3X939 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slc9a3G3X939 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slc9a3G3X939 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slc9a3G3X939 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Slc9a3G3X939 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc9a3G3X939 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc9a3G3X939 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc9a3G3X939 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc9a3G3X939 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc9a3G3X939 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc9a3G3X939 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc9a3G3X939 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc9a3G3X939 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc9a3G3X939 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc9a3G3X939 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc9a3G3X939 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc9a3G3X939 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc9a3G3X939 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc9a3G3X939 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc9a3G3X939 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms