Protein–RNA interactions for Protein: G3UXD1

Speer4c, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4C, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4cG3UXD1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Speer4cG3UXD1 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Speer4cG3UXD1 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Speer4cG3UXD1 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Speer4cG3UXD1 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Speer4cG3UXD1 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Speer4cG3UXD1 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Speer4cG3UXD1 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Speer4cG3UXD1 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Speer4cG3UXD1 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Speer4cG3UXD1 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Speer4cG3UXD1 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Speer4cG3UXD1 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Speer4cG3UXD1 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Speer4cG3UXD1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Speer4cG3UXD1 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Speer4cG3UXD1 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Speer4cG3UXD1 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Speer4cG3UXD1 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Speer4cG3UXD1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Speer4cG3UXD1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Speer4cG3UXD1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Speer4cG3UXD1 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Speer4cG3UXD1 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Speer4cG3UXD1 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Speer4cG3UXD1 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Speer4cG3UXD1 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Speer4cG3UXD1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Speer4cG3UXD1 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Speer4cG3UXD1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Speer4cG3UXD1 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Speer4cG3UXD1 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Speer4cG3UXD1 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Speer4cG3UXD1 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Speer4cG3UXD1 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Speer4cG3UXD1 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Speer4cG3UXD1 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Speer4cG3UXD1 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Speer4cG3UXD1 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Speer4cG3UXD1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Speer4cG3UXD1 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Speer4cG3UXD1 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Speer4cG3UXD1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Speer4cG3UXD1 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Speer4cG3UXD1 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Speer4cG3UXD1 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Speer4cG3UXD1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Speer4cG3UXD1 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Speer4cG3UXD1 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Speer4cG3UXD1 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Speer4cG3UXD1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Speer4cG3UXD1 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Speer4cG3UXD1 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Speer4cG3UXD1 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Speer4cG3UXD1 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Speer4cG3UXD1 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Speer4cG3UXD1 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Speer4cG3UXD1 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Speer4cG3UXD1 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Speer4cG3UXD1 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Speer4cG3UXD1 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Speer4cG3UXD1 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Speer4cG3UXD1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Speer4cG3UXD1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Speer4cG3UXD1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Speer4cG3UXD1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Speer4cG3UXD1 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Speer4cG3UXD1 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Speer4cG3UXD1 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Speer4cG3UXD1 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Speer4cG3UXD1 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Speer4cG3UXD1 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Speer4cG3UXD1 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Speer4cG3UXD1 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Speer4cG3UXD1 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Speer4cG3UXD1 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Speer4cG3UXD1 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Speer4cG3UXD1 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Speer4cG3UXD1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Speer4cG3UXD1 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Speer4cG3UXD1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Speer4cG3UXD1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Speer4cG3UXD1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Speer4cG3UXD1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Speer4cG3UXD1 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Speer4cG3UXD1 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Speer4cG3UXD1 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Speer4cG3UXD1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Speer4cG3UXD1 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Speer4cG3UXD1 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Speer4cG3UXD1 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Speer4cG3UXD1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Speer4cG3UXD1 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Speer4cG3UXD1 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Speer4cG3UXD1 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Speer4cG3UXD1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Speer4cG3UXD1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Speer4cG3UXD1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Speer4cG3UXD1 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Speer4cG3UXD1 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms