Protein–RNA interactions for Protein: G3UXB3

Nkx1-1, NK1 homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-1G3UXB3 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nkx1-1G3UXB3 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nkx1-1G3UXB3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nkx1-1G3UXB3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nkx1-1G3UXB3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nkx1-1G3UXB3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Nkx1-1G3UXB3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nkx1-1G3UXB3 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nkx1-1G3UXB3 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Nkx1-1G3UXB3 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nkx1-1G3UXB3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nkx1-1G3UXB3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nkx1-1G3UXB3 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nkx1-1G3UXB3 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nkx1-1G3UXB3 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nkx1-1G3UXB3 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nkx1-1G3UXB3 Gm37319-201ENSMUST00000193500 636 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Nkx1-1G3UXB3 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nkx1-1G3UXB3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nkx1-1G3UXB3 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nkx1-1G3UXB3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nkx1-1G3UXB3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nkx1-1G3UXB3 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nkx1-1G3UXB3 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nkx1-1G3UXB3 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nkx1-1G3UXB3 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nkx1-1G3UXB3 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nkx1-1G3UXB3 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nkx1-1G3UXB3 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Nkx1-1G3UXB3 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nkx1-1G3UXB3 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nkx1-1G3UXB3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nkx1-1G3UXB3 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nkx1-1G3UXB3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nkx1-1G3UXB3 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nkx1-1G3UXB3 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Nkx1-1G3UXB3 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nkx1-1G3UXB3 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nkx1-1G3UXB3 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nkx1-1G3UXB3 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Nkx1-1G3UXB3 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nkx1-1G3UXB3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nkx1-1G3UXB3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nkx1-1G3UXB3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nkx1-1G3UXB3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nkx1-1G3UXB3 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nkx1-1G3UXB3 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Nkx1-1G3UXB3 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nkx1-1G3UXB3 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nkx1-1G3UXB3 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nkx1-1G3UXB3 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nkx1-1G3UXB3 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nkx1-1G3UXB3 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nkx1-1G3UXB3 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nkx1-1G3UXB3 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nkx1-1G3UXB3 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Nkx1-1G3UXB3 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nkx1-1G3UXB3 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nkx1-1G3UXB3 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nkx1-1G3UXB3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nkx1-1G3UXB3 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nkx1-1G3UXB3 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nkx1-1G3UXB3 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nkx1-1G3UXB3 Hesx1-201ENSMUST00000035433 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nkx1-1G3UXB3 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nkx1-1G3UXB3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nkx1-1G3UXB3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nkx1-1G3UXB3 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nkx1-1G3UXB3 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nkx1-1G3UXB3 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nkx1-1G3UXB3 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nkx1-1G3UXB3 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nkx1-1G3UXB3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nkx1-1G3UXB3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nkx1-1G3UXB3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nkx1-1G3UXB3 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Nkx1-1G3UXB3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nkx1-1G3UXB3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nkx1-1G3UXB3 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nkx1-1G3UXB3 Gm38134-201ENSMUST00000191858 1234 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nkx1-1G3UXB3 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nkx1-1G3UXB3 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nkx1-1G3UXB3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nkx1-1G3UXB3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nkx1-1G3UXB3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nkx1-1G3UXB3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nkx1-1G3UXB3 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nkx1-1G3UXB3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nkx1-1G3UXB3 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nkx1-1G3UXB3 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nkx1-1G3UXB3 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Nkx1-1G3UXB3 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Nkx1-1G3UXB3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nkx1-1G3UXB3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nkx1-1G3UXB3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nkx1-1G3UXB3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nkx1-1G3UXB3 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nkx1-1G3UXB3 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nkx1-1G3UXB3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nkx1-1G3UXB3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms