Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Srp72F8VQC1 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Srp72F8VQC1 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Srp72F8VQC1 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Srp72F8VQC1 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Srp72F8VQC1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Srp72F8VQC1 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Srp72F8VQC1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Srp72F8VQC1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Srp72F8VQC1 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Srp72F8VQC1 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Srp72F8VQC1 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Srp72F8VQC1 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Srp72F8VQC1 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Srp72F8VQC1 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Srp72F8VQC1 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Srp72F8VQC1 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Srp72F8VQC1 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Srp72F8VQC1 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Srp72F8VQC1 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Srp72F8VQC1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Srp72F8VQC1 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Srp72F8VQC1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Srp72F8VQC1 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Srp72F8VQC1 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Srp72F8VQC1 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Srp72F8VQC1 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Srp72F8VQC1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Srp72F8VQC1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Srp72F8VQC1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Srp72F8VQC1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Srp72F8VQC1 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Srp72F8VQC1 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Srp72F8VQC1 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Srp72F8VQC1 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Srp72F8VQC1 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Srp72F8VQC1 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Srp72F8VQC1 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Srp72F8VQC1 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Srp72F8VQC1 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Srp72F8VQC1 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Srp72F8VQC1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Srp72F8VQC1 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Srp72F8VQC1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Srp72F8VQC1 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Srp72F8VQC1 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Srp72F8VQC1 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Srp72F8VQC1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Srp72F8VQC1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Srp72F8VQC1 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Srp72F8VQC1 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Srp72F8VQC1 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Srp72F8VQC1 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Srp72F8VQC1 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Srp72F8VQC1 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Srp72F8VQC1 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Srp72F8VQC1 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Srp72F8VQC1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Srp72F8VQC1 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Srp72F8VQC1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Srp72F8VQC1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Srp72F8VQC1 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Srp72F8VQC1 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Srp72F8VQC1 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Srp72F8VQC1 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Srp72F8VQC1 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Srp72F8VQC1 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Srp72F8VQC1 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Srp72F8VQC1 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Srp72F8VQC1 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Srp72F8VQC1 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Srp72F8VQC1 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Srp72F8VQC1 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Srp72F8VQC1 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Srp72F8VQC1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Srp72F8VQC1 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Srp72F8VQC1 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Srp72F8VQC1 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Srp72F8VQC1 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Srp72F8VQC1 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Srp72F8VQC1 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Srp72F8VQC1 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Srp72F8VQC1 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Srp72F8VQC1 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Srp72F8VQC1 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Srp72F8VQC1 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Srp72F8VQC1 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Srp72F8VQC1 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Srp72F8VQC1 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Srp72F8VQC1 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Srp72F8VQC1 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Srp72F8VQC1 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Srp72F8VQC1 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Srp72F8VQC1 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Srp72F8VQC1 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Srp72F8VQC1 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Srp72F8VQC1 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Srp72F8VQC1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Srp72F8VQC1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Srp72F8VQC1 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms