Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm20538F6Z9R1 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm20538F6Z9R1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm20538F6Z9R1 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm20538F6Z9R1 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm20538F6Z9R1 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm20538F6Z9R1 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm20538F6Z9R1 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm20538F6Z9R1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Gm20538F6Z9R1 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Gm20538F6Z9R1 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Gm20538F6Z9R1 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Gm20538F6Z9R1 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Gm20538F6Z9R1 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Gm20538F6Z9R1 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Gm20538F6Z9R1 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Gm20538F6Z9R1 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Gm20538F6Z9R1 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Gm20538F6Z9R1 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Gm20538F6Z9R1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Gm20538F6Z9R1 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Gm20538F6Z9R1 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Gm20538F6Z9R1 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Gm20538F6Z9R1 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Gm20538F6Z9R1 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Gm20538F6Z9R1 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Gm20538F6Z9R1 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Gm20538F6Z9R1 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Gm20538F6Z9R1 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Gm20538F6Z9R1 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Gm20538F6Z9R1 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Gm20538F6Z9R1 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Gm20538F6Z9R1 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Gm20538F6Z9R1 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Gm20538F6Z9R1 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Gm20538F6Z9R1 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Gm20538F6Z9R1 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Gm20538F6Z9R1 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Gm20538F6Z9R1 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Gm20538F6Z9R1 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Gm20538F6Z9R1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Gm20538F6Z9R1 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Gm20538F6Z9R1 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Gm20538F6Z9R1 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Gm20538F6Z9R1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Gm20538F6Z9R1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Gm20538F6Z9R1 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Gm20538F6Z9R1 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Gm20538F6Z9R1 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Gm20538F6Z9R1 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Gm20538F6Z9R1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Gm20538F6Z9R1 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Gm20538F6Z9R1 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gm20538F6Z9R1 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gm20538F6Z9R1 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gm20538F6Z9R1 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gm20538F6Z9R1 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gm20538F6Z9R1 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gm20538F6Z9R1 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gm20538F6Z9R1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gm20538F6Z9R1 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gm20538F6Z9R1 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gm20538F6Z9R1 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gm20538F6Z9R1 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gm20538F6Z9R1 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gm20538F6Z9R1 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gm20538F6Z9R1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gm20538F6Z9R1 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gm20538F6Z9R1 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gm20538F6Z9R1 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gm20538F6Z9R1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gm20538F6Z9R1 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gm20538F6Z9R1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gm20538F6Z9R1 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gm20538F6Z9R1 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Gm20538F6Z9R1 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Gm20538F6Z9R1 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Gm20538F6Z9R1 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Gm20538F6Z9R1 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Gm20538F6Z9R1 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Gm20538F6Z9R1 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Gm20538F6Z9R1 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Gm20538F6Z9R1 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Gm20538F6Z9R1 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Gm20538F6Z9R1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Gm20538F6Z9R1 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Gm20538F6Z9R1 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Gm20538F6Z9R1 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Gm20538F6Z9R1 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Gm20538F6Z9R1 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Gm20538F6Z9R1 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Gm20538F6Z9R1 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Gm20538F6Z9R1 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Gm20538F6Z9R1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Gm20538F6Z9R1 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Gm20538F6Z9R1 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Gm20538F6Z9R1 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Gm20538F6Z9R1 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Gm20538F6Z9R1 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Gm20538F6Z9R1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms