Protein–RNA interactions for Protein: F6V0H0

Pagr1b, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1B (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1bF6V0H0 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pagr1bF6V0H0 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pagr1bF6V0H0 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pagr1bF6V0H0 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pagr1bF6V0H0 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pagr1bF6V0H0 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pagr1bF6V0H0 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pagr1bF6V0H0 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pagr1bF6V0H0 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pagr1bF6V0H0 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Pagr1bF6V0H0 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pagr1bF6V0H0 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Pagr1bF6V0H0 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pagr1bF6V0H0 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pagr1bF6V0H0 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pagr1bF6V0H0 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pagr1bF6V0H0 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pagr1bF6V0H0 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pagr1bF6V0H0 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pagr1bF6V0H0 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pagr1bF6V0H0 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pagr1bF6V0H0 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pagr1bF6V0H0 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pagr1bF6V0H0 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pagr1bF6V0H0 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pagr1bF6V0H0 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pagr1bF6V0H0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pagr1bF6V0H0 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pagr1bF6V0H0 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Pagr1bF6V0H0 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pagr1bF6V0H0 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Pagr1bF6V0H0 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pagr1bF6V0H0 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pagr1bF6V0H0 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pagr1bF6V0H0 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pagr1bF6V0H0 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Pagr1bF6V0H0 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pagr1bF6V0H0 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pagr1bF6V0H0 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pagr1bF6V0H0 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pagr1bF6V0H0 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Pagr1bF6V0H0 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pagr1bF6V0H0 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Pagr1bF6V0H0 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pagr1bF6V0H0 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pagr1bF6V0H0 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pagr1bF6V0H0 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pagr1bF6V0H0 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pagr1bF6V0H0 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pagr1bF6V0H0 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pagr1bF6V0H0 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Pagr1bF6V0H0 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pagr1bF6V0H0 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pagr1bF6V0H0 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Pagr1bF6V0H0 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pagr1bF6V0H0 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pagr1bF6V0H0 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pagr1bF6V0H0 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pagr1bF6V0H0 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pagr1bF6V0H0 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pagr1bF6V0H0 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pagr1bF6V0H0 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pagr1bF6V0H0 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pagr1bF6V0H0 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pagr1bF6V0H0 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pagr1bF6V0H0 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Pagr1bF6V0H0 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pagr1bF6V0H0 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pagr1bF6V0H0 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pagr1bF6V0H0 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pagr1bF6V0H0 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pagr1bF6V0H0 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pagr1bF6V0H0 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pagr1bF6V0H0 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Pagr1bF6V0H0 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Pagr1bF6V0H0 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Pagr1bF6V0H0 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pagr1bF6V0H0 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Pagr1bF6V0H0 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Pagr1bF6V0H0 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Pagr1bF6V0H0 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pagr1bF6V0H0 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pagr1bF6V0H0 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pagr1bF6V0H0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pagr1bF6V0H0 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pagr1bF6V0H0 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pagr1bF6V0H0 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pagr1bF6V0H0 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pagr1bF6V0H0 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pagr1bF6V0H0 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pagr1bF6V0H0 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pagr1bF6V0H0 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pagr1bF6V0H0 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Pagr1bF6V0H0 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pagr1bF6V0H0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pagr1bF6V0H0 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pagr1bF6V0H0 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pagr1bF6V0H0 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pagr1bF6V0H0 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pagr1bF6V0H0 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms