Protein–RNA interactions for Protein: F6Q785

Gm29094, Predicted gene 29094 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29094F6Q785 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm29094F6Q785 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm29094F6Q785 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm29094F6Q785 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm29094F6Q785 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm29094F6Q785 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm29094F6Q785 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm29094F6Q785 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm29094F6Q785 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm29094F6Q785 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm29094F6Q785 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm29094F6Q785 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm29094F6Q785 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm29094F6Q785 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm29094F6Q785 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm29094F6Q785 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm29094F6Q785 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm29094F6Q785 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm29094F6Q785 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm29094F6Q785 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm29094F6Q785 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm29094F6Q785 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm29094F6Q785 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm29094F6Q785 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm29094F6Q785 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm29094F6Q785 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm29094F6Q785 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm29094F6Q785 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm29094F6Q785 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm29094F6Q785 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm29094F6Q785 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm29094F6Q785 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm29094F6Q785 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm29094F6Q785 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm29094F6Q785 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm29094F6Q785 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm29094F6Q785 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm29094F6Q785 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm29094F6Q785 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm29094F6Q785 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm29094F6Q785 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm29094F6Q785 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm29094F6Q785 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm29094F6Q785 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm29094F6Q785 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm29094F6Q785 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm29094F6Q785 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm29094F6Q785 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm29094F6Q785 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm29094F6Q785 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm29094F6Q785 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm29094F6Q785 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm29094F6Q785 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm29094F6Q785 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm29094F6Q785 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm29094F6Q785 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm29094F6Q785 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm29094F6Q785 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm29094F6Q785 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm29094F6Q785 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm29094F6Q785 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm29094F6Q785 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm29094F6Q785 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm29094F6Q785 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm29094F6Q785 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm29094F6Q785 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm29094F6Q785 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm29094F6Q785 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm29094F6Q785 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm29094F6Q785 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm29094F6Q785 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm29094F6Q785 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm29094F6Q785 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm29094F6Q785 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm29094F6Q785 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm29094F6Q785 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm29094F6Q785 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm29094F6Q785 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm29094F6Q785 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm29094F6Q785 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm29094F6Q785 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm29094F6Q785 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm29094F6Q785 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm29094F6Q785 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm29094F6Q785 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm29094F6Q785 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm29094F6Q785 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm29094F6Q785 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm29094F6Q785 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm29094F6Q785 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm29094F6Q785 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm29094F6Q785 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm29094F6Q785 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm29094F6Q785 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm29094F6Q785 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm29094F6Q785 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm29094F6Q785 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm29094F6Q785 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm29094F6Q785 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm29094F6Q785 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms