Protein–RNA interactions for Protein: E9QAU8

Rnf165, E3 ubiquitin-protein ligase RNF165, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf165E9QAU8 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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Rnf165E9QAU8 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rnf165E9QAU8 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rnf165E9QAU8 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rnf165E9QAU8 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rnf165E9QAU8 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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Rnf165E9QAU8 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rnf165E9QAU8 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rnf165E9QAU8 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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Rnf165E9QAU8 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Rnf165E9QAU8 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnf165E9QAU8 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnf165E9QAU8 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Rnf165E9QAU8 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Rnf165E9QAU8 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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Rnf165E9QAU8 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf165E9QAU8 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf165E9QAU8 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf165E9QAU8 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf165E9QAU8 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf165E9QAU8 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf165E9QAU8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf165E9QAU8 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf165E9QAU8 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf165E9QAU8 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf165E9QAU8 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf165E9QAU8 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf165E9QAU8 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf165E9QAU8 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf165E9QAU8 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf165E9QAU8 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf165E9QAU8 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf165E9QAU8 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
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