Protein–RNA interactions for Protein: E9QA15

Cald1, Caldesmon 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cald1E9QA15 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cald1E9QA15 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cald1E9QA15 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Cald1E9QA15 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cald1E9QA15 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cald1E9QA15 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Cald1E9QA15 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Cald1E9QA15 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Cald1E9QA15 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cald1E9QA15 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cald1E9QA15 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cald1E9QA15 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Cald1E9QA15 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cald1E9QA15 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cald1E9QA15 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cald1E9QA15 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cald1E9QA15 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cald1E9QA15 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cald1E9QA15 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cald1E9QA15 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Cald1E9QA15 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Cald1E9QA15 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cald1E9QA15 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cald1E9QA15 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cald1E9QA15 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cald1E9QA15 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cald1E9QA15 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Cald1E9QA15 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Cald1E9QA15 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Cald1E9QA15 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cald1E9QA15 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cald1E9QA15 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cald1E9QA15 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cald1E9QA15 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cald1E9QA15 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cald1E9QA15 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cald1E9QA15 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Cald1E9QA15 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cald1E9QA15 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cald1E9QA15 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cald1E9QA15 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cald1E9QA15 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cald1E9QA15 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cald1E9QA15 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cald1E9QA15 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cald1E9QA15 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cald1E9QA15 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cald1E9QA15 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cald1E9QA15 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cald1E9QA15 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cald1E9QA15 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cald1E9QA15 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cald1E9QA15 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cald1E9QA15 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cald1E9QA15 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cald1E9QA15 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cald1E9QA15 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cald1E9QA15 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cald1E9QA15 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cald1E9QA15 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Cald1E9QA15 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Cald1E9QA15 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Cald1E9QA15 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cald1E9QA15 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cald1E9QA15 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cald1E9QA15 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cald1E9QA15 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cald1E9QA15 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cald1E9QA15 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cald1E9QA15 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cald1E9QA15 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cald1E9QA15 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cald1E9QA15 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cald1E9QA15 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cald1E9QA15 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cald1E9QA15 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cald1E9QA15 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cald1E9QA15 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cald1E9QA15 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cald1E9QA15 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cald1E9QA15 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cald1E9QA15 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cald1E9QA15 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cald1E9QA15 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cald1E9QA15 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cald1E9QA15 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cald1E9QA15 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cald1E9QA15 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cald1E9QA15 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cald1E9QA15 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cald1E9QA15 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cald1E9QA15 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cald1E9QA15 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cald1E9QA15 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Cald1E9QA15 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cald1E9QA15 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cald1E9QA15 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cald1E9QA15 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cald1E9QA15 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Cald1E9QA15 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms