Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7P1

Col22a1, Collagen, type XXII, alpha 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col22a1E9Q7P1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Col22a1E9Q7P1 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Col22a1E9Q7P1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Col22a1E9Q7P1 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Col22a1E9Q7P1 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Col22a1E9Q7P1 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Col22a1E9Q7P1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Col22a1E9Q7P1 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Col22a1E9Q7P1 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Col22a1E9Q7P1 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Col22a1E9Q7P1 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Col22a1E9Q7P1 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Col22a1E9Q7P1 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Col22a1E9Q7P1 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Col22a1E9Q7P1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Col22a1E9Q7P1 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Col22a1E9Q7P1 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Col22a1E9Q7P1 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Col22a1E9Q7P1 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Col22a1E9Q7P1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Col22a1E9Q7P1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Col22a1E9Q7P1 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Col22a1E9Q7P1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Col22a1E9Q7P1 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Col22a1E9Q7P1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Col22a1E9Q7P1 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Col22a1E9Q7P1 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Col22a1E9Q7P1 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Col22a1E9Q7P1 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Col22a1E9Q7P1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Col22a1E9Q7P1 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Col22a1E9Q7P1 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Col22a1E9Q7P1 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Col22a1E9Q7P1 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Col22a1E9Q7P1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Col22a1E9Q7P1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Col22a1E9Q7P1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Col22a1E9Q7P1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Col22a1E9Q7P1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Col22a1E9Q7P1 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Col22a1E9Q7P1 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Col22a1E9Q7P1 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Col22a1E9Q7P1 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Col22a1E9Q7P1 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Col22a1E9Q7P1 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Col22a1E9Q7P1 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Col22a1E9Q7P1 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Col22a1E9Q7P1 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Col22a1E9Q7P1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Col22a1E9Q7P1 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Col22a1E9Q7P1 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Col22a1E9Q7P1 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Col22a1E9Q7P1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Col22a1E9Q7P1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Col22a1E9Q7P1 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Col22a1E9Q7P1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Col22a1E9Q7P1 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Col22a1E9Q7P1 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Col22a1E9Q7P1 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Col22a1E9Q7P1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Col22a1E9Q7P1 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Col22a1E9Q7P1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Col22a1E9Q7P1 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Col22a1E9Q7P1 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Col22a1E9Q7P1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Col22a1E9Q7P1 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Col22a1E9Q7P1 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Col22a1E9Q7P1 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Col22a1E9Q7P1 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Col22a1E9Q7P1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Col22a1E9Q7P1 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Col22a1E9Q7P1 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Col22a1E9Q7P1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Col22a1E9Q7P1 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Col22a1E9Q7P1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Col22a1E9Q7P1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Col22a1E9Q7P1 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Col22a1E9Q7P1 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Col22a1E9Q7P1 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Col22a1E9Q7P1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Col22a1E9Q7P1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Col22a1E9Q7P1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Col22a1E9Q7P1 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Col22a1E9Q7P1 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Col22a1E9Q7P1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Col22a1E9Q7P1 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Col22a1E9Q7P1 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Col22a1E9Q7P1 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Col22a1E9Q7P1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Col22a1E9Q7P1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Col22a1E9Q7P1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Col22a1E9Q7P1 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Col22a1E9Q7P1 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Col22a1E9Q7P1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Col22a1E9Q7P1 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Col22a1E9Q7P1 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Col22a1E9Q7P1 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Col22a1E9Q7P1 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Col22a1E9Q7P1 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Col22a1E9Q7P1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms