Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7L1

Urb2, URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb2E9Q7L1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Urb2E9Q7L1 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Urb2E9Q7L1 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC31.78■■■□□ 2.68
Urb2E9Q7L1 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
Urb2E9Q7L1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
Urb2E9Q7L1 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Urb2E9Q7L1 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Urb2E9Q7L1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Urb2E9Q7L1 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Urb2E9Q7L1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Urb2E9Q7L1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.68
Urb2E9Q7L1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
Urb2E9Q7L1 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC31.76■■■□□ 2.68
Urb2E9Q7L1 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
Urb2E9Q7L1 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
Urb2E9Q7L1 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
Urb2E9Q7L1 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
Urb2E9Q7L1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Urb2E9Q7L1 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
Urb2E9Q7L1 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Urb2E9Q7L1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Urb2E9Q7L1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Urb2E9Q7L1 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
Urb2E9Q7L1 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Urb2E9Q7L1 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Urb2E9Q7L1 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Urb2E9Q7L1 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Urb2E9Q7L1 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
Urb2E9Q7L1 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
Urb2E9Q7L1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
Urb2E9Q7L1 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Urb2E9Q7L1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
Urb2E9Q7L1 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Urb2E9Q7L1 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
Urb2E9Q7L1 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
Urb2E9Q7L1 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
Urb2E9Q7L1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Urb2E9Q7L1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Urb2E9Q7L1 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC31.73■■■□□ 2.67
Urb2E9Q7L1 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Urb2E9Q7L1 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Urb2E9Q7L1 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Urb2E9Q7L1 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Urb2E9Q7L1 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Urb2E9Q7L1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Urb2E9Q7L1 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Urb2E9Q7L1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Urb2E9Q7L1 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Urb2E9Q7L1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Urb2E9Q7L1 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
Urb2E9Q7L1 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Urb2E9Q7L1 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
Urb2E9Q7L1 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
Urb2E9Q7L1 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Urb2E9Q7L1 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Urb2E9Q7L1 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Urb2E9Q7L1 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Urb2E9Q7L1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Urb2E9Q7L1 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
Urb2E9Q7L1 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
Urb2E9Q7L1 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC31.7■■■□□ 2.67
Urb2E9Q7L1 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC31.7■■■□□ 2.67
Urb2E9Q7L1 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC31.7■■■□□ 2.67
Urb2E9Q7L1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.7■■■□□ 2.67
Urb2E9Q7L1 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Urb2E9Q7L1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.66
Urb2E9Q7L1 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
Urb2E9Q7L1 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC31.7■■■□□ 2.66
Urb2E9Q7L1 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC31.7■■■□□ 2.66
Urb2E9Q7L1 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
Urb2E9Q7L1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Urb2E9Q7L1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Urb2E9Q7L1 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
Urb2E9Q7L1 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Urb2E9Q7L1 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
Urb2E9Q7L1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
Urb2E9Q7L1 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC31.68■■■□□ 2.66
Urb2E9Q7L1 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
Urb2E9Q7L1 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
Urb2E9Q7L1 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Urb2E9Q7L1 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
Urb2E9Q7L1 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
Urb2E9Q7L1 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC31.68■■■□□ 2.66
Urb2E9Q7L1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC31.67■■■□□ 2.66
Urb2E9Q7L1 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Urb2E9Q7L1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC31.67■■■□□ 2.66
Urb2E9Q7L1 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Urb2E9Q7L1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Urb2E9Q7L1 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Urb2E9Q7L1 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Urb2E9Q7L1 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
Urb2E9Q7L1 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Urb2E9Q7L1 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Urb2E9Q7L1 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
Urb2E9Q7L1 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Urb2E9Q7L1 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Urb2E9Q7L1 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
Urb2E9Q7L1 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Urb2E9Q7L1 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Urb2E9Q7L1 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 225.1 ms