Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6R7

Utrn, Utrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UtrnE9Q6R7 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UtrnE9Q6R7 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UtrnE9Q6R7 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UtrnE9Q6R7 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UtrnE9Q6R7 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UtrnE9Q6R7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UtrnE9Q6R7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UtrnE9Q6R7 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UtrnE9Q6R7 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
UtrnE9Q6R7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UtrnE9Q6R7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UtrnE9Q6R7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UtrnE9Q6R7 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UtrnE9Q6R7 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UtrnE9Q6R7 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UtrnE9Q6R7 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UtrnE9Q6R7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UtrnE9Q6R7 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UtrnE9Q6R7 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UtrnE9Q6R7 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UtrnE9Q6R7 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UtrnE9Q6R7 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UtrnE9Q6R7 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
UtrnE9Q6R7 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
UtrnE9Q6R7 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
UtrnE9Q6R7 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UtrnE9Q6R7 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UtrnE9Q6R7 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UtrnE9Q6R7 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UtrnE9Q6R7 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UtrnE9Q6R7 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UtrnE9Q6R7 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC23■■□□□ 1.27
UtrnE9Q6R7 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UtrnE9Q6R7 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UtrnE9Q6R7 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UtrnE9Q6R7 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC23■■□□□ 1.27
UtrnE9Q6R7 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UtrnE9Q6R7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
UtrnE9Q6R7 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UtrnE9Q6R7 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UtrnE9Q6R7 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UtrnE9Q6R7 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UtrnE9Q6R7 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UtrnE9Q6R7 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UtrnE9Q6R7 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UtrnE9Q6R7 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UtrnE9Q6R7 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
UtrnE9Q6R7 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UtrnE9Q6R7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UtrnE9Q6R7 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UtrnE9Q6R7 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UtrnE9Q6R7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UtrnE9Q6R7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UtrnE9Q6R7 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UtrnE9Q6R7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UtrnE9Q6R7 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UtrnE9Q6R7 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UtrnE9Q6R7 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UtrnE9Q6R7 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UtrnE9Q6R7 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UtrnE9Q6R7 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UtrnE9Q6R7 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UtrnE9Q6R7 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UtrnE9Q6R7 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UtrnE9Q6R7 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UtrnE9Q6R7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UtrnE9Q6R7 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UtrnE9Q6R7 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UtrnE9Q6R7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UtrnE9Q6R7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UtrnE9Q6R7 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UtrnE9Q6R7 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UtrnE9Q6R7 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UtrnE9Q6R7 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UtrnE9Q6R7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UtrnE9Q6R7 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UtrnE9Q6R7 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UtrnE9Q6R7 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UtrnE9Q6R7 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UtrnE9Q6R7 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UtrnE9Q6R7 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UtrnE9Q6R7 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UtrnE9Q6R7 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UtrnE9Q6R7 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UtrnE9Q6R7 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UtrnE9Q6R7 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UtrnE9Q6R7 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UtrnE9Q6R7 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UtrnE9Q6R7 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UtrnE9Q6R7 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UtrnE9Q6R7 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UtrnE9Q6R7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UtrnE9Q6R7 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UtrnE9Q6R7 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
UtrnE9Q6R7 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UtrnE9Q6R7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UtrnE9Q6R7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UtrnE9Q6R7 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UtrnE9Q6R7 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UtrnE9Q6R7 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms