Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6E5

Srsf11, Serine/arginine-rich-splicing factor 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf11E9Q6E5 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Srsf11E9Q6E5 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Srsf11E9Q6E5 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Srsf11E9Q6E5 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Srsf11E9Q6E5 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Srsf11E9Q6E5 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Srsf11E9Q6E5 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Srsf11E9Q6E5 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Srsf11E9Q6E5 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Srsf11E9Q6E5 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Srsf11E9Q6E5 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Srsf11E9Q6E5 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Srsf11E9Q6E5 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Srsf11E9Q6E5 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Srsf11E9Q6E5 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Srsf11E9Q6E5 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Srsf11E9Q6E5 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Srsf11E9Q6E5 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Srsf11E9Q6E5 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Srsf11E9Q6E5 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Srsf11E9Q6E5 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Srsf11E9Q6E5 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Srsf11E9Q6E5 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Srsf11E9Q6E5 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Srsf11E9Q6E5 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Srsf11E9Q6E5 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Srsf11E9Q6E5 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Srsf11E9Q6E5 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Srsf11E9Q6E5 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Srsf11E9Q6E5 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Srsf11E9Q6E5 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Srsf11E9Q6E5 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Srsf11E9Q6E5 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Srsf11E9Q6E5 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Srsf11E9Q6E5 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Srsf11E9Q6E5 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Srsf11E9Q6E5 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Srsf11E9Q6E5 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Srsf11E9Q6E5 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Srsf11E9Q6E5 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Srsf11E9Q6E5 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Srsf11E9Q6E5 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Srsf11E9Q6E5 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Srsf11E9Q6E5 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Srsf11E9Q6E5 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Srsf11E9Q6E5 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Srsf11E9Q6E5 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Srsf11E9Q6E5 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Srsf11E9Q6E5 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Srsf11E9Q6E5 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Srsf11E9Q6E5 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Srsf11E9Q6E5 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Srsf11E9Q6E5 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Srsf11E9Q6E5 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Srsf11E9Q6E5 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Srsf11E9Q6E5 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Srsf11E9Q6E5 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Srsf11E9Q6E5 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Srsf11E9Q6E5 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Srsf11E9Q6E5 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Srsf11E9Q6E5 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Srsf11E9Q6E5 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Srsf11E9Q6E5 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Srsf11E9Q6E5 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Srsf11E9Q6E5 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Srsf11E9Q6E5 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Srsf11E9Q6E5 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Srsf11E9Q6E5 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Srsf11E9Q6E5 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Srsf11E9Q6E5 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Srsf11E9Q6E5 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Srsf11E9Q6E5 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Srsf11E9Q6E5 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Srsf11E9Q6E5 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Srsf11E9Q6E5 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Srsf11E9Q6E5 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Srsf11E9Q6E5 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Srsf11E9Q6E5 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Srsf11E9Q6E5 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Srsf11E9Q6E5 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Srsf11E9Q6E5 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Srsf11E9Q6E5 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Srsf11E9Q6E5 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Srsf11E9Q6E5 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Srsf11E9Q6E5 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Srsf11E9Q6E5 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Srsf11E9Q6E5 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Srsf11E9Q6E5 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Srsf11E9Q6E5 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Srsf11E9Q6E5 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Srsf11E9Q6E5 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Srsf11E9Q6E5 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Srsf11E9Q6E5 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Srsf11E9Q6E5 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Srsf11E9Q6E5 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Srsf11E9Q6E5 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Srsf11E9Q6E5 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Srsf11E9Q6E5 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Srsf11E9Q6E5 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Srsf11E9Q6E5 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms