Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6B2

Ccdc85c, Coiled-coil domain-containing protein 85C, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85cE9Q6B2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc85cE9Q6B2 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc85cE9Q6B2 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc85cE9Q6B2 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc85cE9Q6B2 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc85cE9Q6B2 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc85cE9Q6B2 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc85cE9Q6B2 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc85cE9Q6B2 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc85cE9Q6B2 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc85cE9Q6B2 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc85cE9Q6B2 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc85cE9Q6B2 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc85cE9Q6B2 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc85cE9Q6B2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc85cE9Q6B2 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc85cE9Q6B2 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc85cE9Q6B2 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc85cE9Q6B2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc85cE9Q6B2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc85cE9Q6B2 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc85cE9Q6B2 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc85cE9Q6B2 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc85cE9Q6B2 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc85cE9Q6B2 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc85cE9Q6B2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc85cE9Q6B2 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc85cE9Q6B2 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc85cE9Q6B2 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc85cE9Q6B2 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc85cE9Q6B2 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc85cE9Q6B2 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc85cE9Q6B2 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc85cE9Q6B2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc85cE9Q6B2 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc85cE9Q6B2 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc85cE9Q6B2 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc85cE9Q6B2 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc85cE9Q6B2 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc85cE9Q6B2 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc85cE9Q6B2 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc85cE9Q6B2 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc85cE9Q6B2 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc85cE9Q6B2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc85cE9Q6B2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc85cE9Q6B2 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc85cE9Q6B2 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc85cE9Q6B2 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc85cE9Q6B2 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc85cE9Q6B2 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc85cE9Q6B2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc85cE9Q6B2 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc85cE9Q6B2 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc85cE9Q6B2 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc85cE9Q6B2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc85cE9Q6B2 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc85cE9Q6B2 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc85cE9Q6B2 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc85cE9Q6B2 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc85cE9Q6B2 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc85cE9Q6B2 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc85cE9Q6B2 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc85cE9Q6B2 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc85cE9Q6B2 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc85cE9Q6B2 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc85cE9Q6B2 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc85cE9Q6B2 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc85cE9Q6B2 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc85cE9Q6B2 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc85cE9Q6B2 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc85cE9Q6B2 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc85cE9Q6B2 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc85cE9Q6B2 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc85cE9Q6B2 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc85cE9Q6B2 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc85cE9Q6B2 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc85cE9Q6B2 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc85cE9Q6B2 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc85cE9Q6B2 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc85cE9Q6B2 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc85cE9Q6B2 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc85cE9Q6B2 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc85cE9Q6B2 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc85cE9Q6B2 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc85cE9Q6B2 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc85cE9Q6B2 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc85cE9Q6B2 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc85cE9Q6B2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc85cE9Q6B2 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc85cE9Q6B2 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc85cE9Q6B2 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc85cE9Q6B2 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc85cE9Q6B2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc85cE9Q6B2 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc85cE9Q6B2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc85cE9Q6B2 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc85cE9Q6B2 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc85cE9Q6B2 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc85cE9Q6B2 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc85cE9Q6B2 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms