Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5K9

Ythdc1, YTH domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdc1E9Q5K9 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ythdc1E9Q5K9 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ythdc1E9Q5K9 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ythdc1E9Q5K9 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ythdc1E9Q5K9 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ythdc1E9Q5K9 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ythdc1E9Q5K9 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ythdc1E9Q5K9 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ythdc1E9Q5K9 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ythdc1E9Q5K9 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ythdc1E9Q5K9 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ythdc1E9Q5K9 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ythdc1E9Q5K9 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ythdc1E9Q5K9 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ythdc1E9Q5K9 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ythdc1E9Q5K9 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ythdc1E9Q5K9 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ythdc1E9Q5K9 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ythdc1E9Q5K9 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ythdc1E9Q5K9 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Ythdc1E9Q5K9 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ythdc1E9Q5K9 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ythdc1E9Q5K9 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Ythdc1E9Q5K9 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Ythdc1E9Q5K9 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ythdc1E9Q5K9 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ythdc1E9Q5K9 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ythdc1E9Q5K9 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Ythdc1E9Q5K9 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ythdc1E9Q5K9 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ythdc1E9Q5K9 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ythdc1E9Q5K9 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ythdc1E9Q5K9 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ythdc1E9Q5K9 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ythdc1E9Q5K9 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ythdc1E9Q5K9 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ythdc1E9Q5K9 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ythdc1E9Q5K9 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ythdc1E9Q5K9 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ythdc1E9Q5K9 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ythdc1E9Q5K9 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ythdc1E9Q5K9 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ythdc1E9Q5K9 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ythdc1E9Q5K9 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ythdc1E9Q5K9 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ythdc1E9Q5K9 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ythdc1E9Q5K9 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ythdc1E9Q5K9 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ythdc1E9Q5K9 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ythdc1E9Q5K9 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ythdc1E9Q5K9 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ythdc1E9Q5K9 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ythdc1E9Q5K9 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ythdc1E9Q5K9 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ythdc1E9Q5K9 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ythdc1E9Q5K9 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ythdc1E9Q5K9 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ythdc1E9Q5K9 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ythdc1E9Q5K9 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ythdc1E9Q5K9 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ythdc1E9Q5K9 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ythdc1E9Q5K9 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ythdc1E9Q5K9 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Ythdc1E9Q5K9 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ythdc1E9Q5K9 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ythdc1E9Q5K9 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ythdc1E9Q5K9 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ythdc1E9Q5K9 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ythdc1E9Q5K9 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ythdc1E9Q5K9 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ythdc1E9Q5K9 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ythdc1E9Q5K9 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ythdc1E9Q5K9 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ythdc1E9Q5K9 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ythdc1E9Q5K9 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ythdc1E9Q5K9 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ythdc1E9Q5K9 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ythdc1E9Q5K9 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ythdc1E9Q5K9 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ythdc1E9Q5K9 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ythdc1E9Q5K9 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ythdc1E9Q5K9 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ythdc1E9Q5K9 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Ythdc1E9Q5K9 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ythdc1E9Q5K9 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ythdc1E9Q5K9 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ythdc1E9Q5K9 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ythdc1E9Q5K9 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ythdc1E9Q5K9 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ythdc1E9Q5K9 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ythdc1E9Q5K9 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ythdc1E9Q5K9 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Ythdc1E9Q5K9 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Ythdc1E9Q5K9 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ythdc1E9Q5K9 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ythdc1E9Q5K9 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ythdc1E9Q5K9 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ythdc1E9Q5K9 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ythdc1E9Q5K9 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ythdc1E9Q5K9 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms