Protein–RNA interactions for Protein: E9Q548

Gm20518, Predicted gene 20518, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20518E9Q548 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm20518E9Q548 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm20518E9Q548 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm20518E9Q548 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm20518E9Q548 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm20518E9Q548 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm20518E9Q548 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm20518E9Q548 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20518E9Q548 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20518E9Q548 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20518E9Q548 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20518E9Q548 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20518E9Q548 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20518E9Q548 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20518E9Q548 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20518E9Q548 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20518E9Q548 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20518E9Q548 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20518E9Q548 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20518E9Q548 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20518E9Q548 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20518E9Q548 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm20518E9Q548 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm20518E9Q548 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm20518E9Q548 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm20518E9Q548 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm20518E9Q548 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm20518E9Q548 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm20518E9Q548 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm20518E9Q548 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm20518E9Q548 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm20518E9Q548 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm20518E9Q548 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm20518E9Q548 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm20518E9Q548 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm20518E9Q548 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm20518E9Q548 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm20518E9Q548 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm20518E9Q548 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm20518E9Q548 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm20518E9Q548 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm20518E9Q548 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm20518E9Q548 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm20518E9Q548 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm20518E9Q548 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm20518E9Q548 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm20518E9Q548 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm20518E9Q548 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm20518E9Q548 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm20518E9Q548 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm20518E9Q548 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm20518E9Q548 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm20518E9Q548 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm20518E9Q548 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm20518E9Q548 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm20518E9Q548 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm20518E9Q548 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm20518E9Q548 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm20518E9Q548 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm20518E9Q548 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm20518E9Q548 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm20518E9Q548 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm20518E9Q548 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm20518E9Q548 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm20518E9Q548 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm20518E9Q548 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm20518E9Q548 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm20518E9Q548 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm20518E9Q548 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm20518E9Q548 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm20518E9Q548 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm20518E9Q548 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm20518E9Q548 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm20518E9Q548 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm20518E9Q548 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm20518E9Q548 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm20518E9Q548 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm20518E9Q548 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm20518E9Q548 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm20518E9Q548 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm20518E9Q548 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm20518E9Q548 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm20518E9Q548 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm20518E9Q548 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm20518E9Q548 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm20518E9Q548 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm20518E9Q548 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm20518E9Q548 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm20518E9Q548 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm20518E9Q548 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm20518E9Q548 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm20518E9Q548 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm20518E9Q548 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm20518E9Q548 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm20518E9Q548 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm20518E9Q548 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm20518E9Q548 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm20518E9Q548 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm20518E9Q548 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm20518E9Q548 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms