Protein–RNA interactions for Protein: E9Q492

Pgbd1, PiggyBac transposable element-derived 1, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgbd1E9Q492 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pgbd1E9Q492 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Pgbd1E9Q492 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pgbd1E9Q492 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Pgbd1E9Q492 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Pgbd1E9Q492 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Pgbd1E9Q492 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Pgbd1E9Q492 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Pgbd1E9Q492 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pgbd1E9Q492 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pgbd1E9Q492 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pgbd1E9Q492 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pgbd1E9Q492 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pgbd1E9Q492 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pgbd1E9Q492 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pgbd1E9Q492 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pgbd1E9Q492 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pgbd1E9Q492 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Pgbd1E9Q492 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pgbd1E9Q492 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pgbd1E9Q492 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pgbd1E9Q492 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pgbd1E9Q492 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pgbd1E9Q492 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pgbd1E9Q492 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pgbd1E9Q492 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pgbd1E9Q492 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pgbd1E9Q492 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pgbd1E9Q492 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pgbd1E9Q492 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pgbd1E9Q492 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pgbd1E9Q492 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pgbd1E9Q492 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pgbd1E9Q492 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pgbd1E9Q492 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pgbd1E9Q492 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pgbd1E9Q492 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pgbd1E9Q492 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pgbd1E9Q492 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pgbd1E9Q492 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pgbd1E9Q492 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pgbd1E9Q492 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pgbd1E9Q492 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pgbd1E9Q492 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pgbd1E9Q492 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pgbd1E9Q492 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pgbd1E9Q492 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pgbd1E9Q492 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pgbd1E9Q492 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pgbd1E9Q492 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pgbd1E9Q492 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pgbd1E9Q492 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pgbd1E9Q492 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pgbd1E9Q492 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pgbd1E9Q492 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pgbd1E9Q492 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pgbd1E9Q492 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pgbd1E9Q492 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pgbd1E9Q492 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pgbd1E9Q492 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pgbd1E9Q492 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pgbd1E9Q492 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Pgbd1E9Q492 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pgbd1E9Q492 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pgbd1E9Q492 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pgbd1E9Q492 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pgbd1E9Q492 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pgbd1E9Q492 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Pgbd1E9Q492 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pgbd1E9Q492 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pgbd1E9Q492 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pgbd1E9Q492 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Pgbd1E9Q492 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pgbd1E9Q492 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pgbd1E9Q492 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pgbd1E9Q492 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pgbd1E9Q492 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pgbd1E9Q492 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pgbd1E9Q492 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pgbd1E9Q492 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pgbd1E9Q492 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pgbd1E9Q492 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pgbd1E9Q492 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pgbd1E9Q492 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pgbd1E9Q492 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pgbd1E9Q492 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pgbd1E9Q492 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pgbd1E9Q492 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pgbd1E9Q492 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pgbd1E9Q492 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pgbd1E9Q492 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pgbd1E9Q492 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pgbd1E9Q492 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pgbd1E9Q492 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pgbd1E9Q492 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pgbd1E9Q492 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pgbd1E9Q492 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pgbd1E9Q492 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pgbd1E9Q492 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pgbd1E9Q492 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms