Protein–RNA interactions for Protein: E9Q373

Vmn1r238, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r238E9Q373 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r238E9Q373 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r238E9Q373 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r238E9Q373 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r238E9Q373 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r238E9Q373 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r238E9Q373 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r238E9Q373 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r238E9Q373 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r238E9Q373 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r238E9Q373 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r238E9Q373 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r238E9Q373 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r238E9Q373 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r238E9Q373 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r238E9Q373 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r238E9Q373 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r238E9Q373 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r238E9Q373 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r238E9Q373 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r238E9Q373 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r238E9Q373 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r238E9Q373 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r238E9Q373 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r238E9Q373 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r238E9Q373 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r238E9Q373 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r238E9Q373 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn1r238E9Q373 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn1r238E9Q373 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn1r238E9Q373 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn1r238E9Q373 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn1r238E9Q373 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn1r238E9Q373 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn1r238E9Q373 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn1r238E9Q373 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn1r238E9Q373 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn1r238E9Q373 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Vmn1r238E9Q373 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Vmn1r238E9Q373 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vmn1r238E9Q373 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vmn1r238E9Q373 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vmn1r238E9Q373 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vmn1r238E9Q373 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vmn1r238E9Q373 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vmn1r238E9Q373 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vmn1r238E9Q373 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn1r238E9Q373 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn1r238E9Q373 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn1r238E9Q373 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn1r238E9Q373 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn1r238E9Q373 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn1r238E9Q373 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn1r238E9Q373 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn1r238E9Q373 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn1r238E9Q373 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn1r238E9Q373 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn1r238E9Q373 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn1r238E9Q373 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn1r238E9Q373 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn1r238E9Q373 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn1r238E9Q373 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn1r238E9Q373 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r238E9Q373 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r238E9Q373 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r238E9Q373 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r238E9Q373 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r238E9Q373 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r238E9Q373 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r238E9Q373 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r238E9Q373 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r238E9Q373 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r238E9Q373 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r238E9Q373 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r238E9Q373 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r238E9Q373 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r238E9Q373 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r238E9Q373 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vmn1r238E9Q373 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vmn1r238E9Q373 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vmn1r238E9Q373 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vmn1r238E9Q373 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vmn1r238E9Q373 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vmn1r238E9Q373 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vmn1r238E9Q373 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r238E9Q373 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r238E9Q373 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r238E9Q373 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r238E9Q373 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r238E9Q373 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r238E9Q373 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r238E9Q373 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r238E9Q373 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r238E9Q373 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r238E9Q373 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r238E9Q373 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r238E9Q373 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r238E9Q373 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn1r238E9Q373 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn1r238E9Q373 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms