Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1U1

Ccdc171, Coiled-coil domain-containing protein 171, mousemouse

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Length 1,324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc171E9Q1U1 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc171E9Q1U1 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc171E9Q1U1 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc171E9Q1U1 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc171E9Q1U1 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc171E9Q1U1 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc171E9Q1U1 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc171E9Q1U1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc171E9Q1U1 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc171E9Q1U1 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc171E9Q1U1 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc171E9Q1U1 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc171E9Q1U1 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc171E9Q1U1 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc171E9Q1U1 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc171E9Q1U1 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc171E9Q1U1 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc171E9Q1U1 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc171E9Q1U1 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc171E9Q1U1 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc171E9Q1U1 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc171E9Q1U1 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc171E9Q1U1 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc171E9Q1U1 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc171E9Q1U1 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc171E9Q1U1 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc171E9Q1U1 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc171E9Q1U1 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc171E9Q1U1 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc171E9Q1U1 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc171E9Q1U1 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc171E9Q1U1 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc171E9Q1U1 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc171E9Q1U1 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc171E9Q1U1 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc171E9Q1U1 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc171E9Q1U1 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc171E9Q1U1 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc171E9Q1U1 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc171E9Q1U1 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc171E9Q1U1 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc171E9Q1U1 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc171E9Q1U1 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc171E9Q1U1 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc171E9Q1U1 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc171E9Q1U1 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc171E9Q1U1 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc171E9Q1U1 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc171E9Q1U1 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc171E9Q1U1 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc171E9Q1U1 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc171E9Q1U1 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc171E9Q1U1 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc171E9Q1U1 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc171E9Q1U1 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc171E9Q1U1 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc171E9Q1U1 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc171E9Q1U1 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc171E9Q1U1 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc171E9Q1U1 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc171E9Q1U1 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc171E9Q1U1 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc171E9Q1U1 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc171E9Q1U1 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc171E9Q1U1 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc171E9Q1U1 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc171E9Q1U1 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc171E9Q1U1 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc171E9Q1U1 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc171E9Q1U1 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc171E9Q1U1 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc171E9Q1U1 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc171E9Q1U1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ccdc171E9Q1U1 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ccdc171E9Q1U1 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc171E9Q1U1 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc171E9Q1U1 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc171E9Q1U1 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc171E9Q1U1 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc171E9Q1U1 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc171E9Q1U1 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc171E9Q1U1 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc171E9Q1U1 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc171E9Q1U1 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc171E9Q1U1 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc171E9Q1U1 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc171E9Q1U1 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc171E9Q1U1 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc171E9Q1U1 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc171E9Q1U1 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc171E9Q1U1 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc171E9Q1U1 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc171E9Q1U1 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc171E9Q1U1 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc171E9Q1U1 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc171E9Q1U1 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc171E9Q1U1 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc171E9Q1U1 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc171E9Q1U1 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc171E9Q1U1 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
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