Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1J0

Zfp558, Zinc finger protein 558, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp558E9Q1J0 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Zfp558E9Q1J0 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Zfp558E9Q1J0 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Zfp558E9Q1J0 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Zfp558E9Q1J0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Zfp558E9Q1J0 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Zfp558E9Q1J0 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Zfp558E9Q1J0 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Zfp558E9Q1J0 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Zfp558E9Q1J0 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Zfp558E9Q1J0 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Zfp558E9Q1J0 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Zfp558E9Q1J0 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Zfp558E9Q1J0 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Zfp558E9Q1J0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Zfp558E9Q1J0 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
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Zfp558E9Q1J0 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Zfp558E9Q1J0 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Zfp558E9Q1J0 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Zfp558E9Q1J0 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Zfp558E9Q1J0 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Zfp558E9Q1J0 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Zfp558E9Q1J0 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Zfp558E9Q1J0 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Zfp558E9Q1J0 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Zfp558E9Q1J0 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Zfp558E9Q1J0 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Zfp558E9Q1J0 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Zfp558E9Q1J0 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Zfp558E9Q1J0 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Zfp558E9Q1J0 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Zfp558E9Q1J0 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Zfp558E9Q1J0 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Zfp558E9Q1J0 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Zfp558E9Q1J0 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Zfp558E9Q1J0 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Zfp558E9Q1J0 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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Zfp558E9Q1J0 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Zfp558E9Q1J0 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Zfp558E9Q1J0 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Zfp558E9Q1J0 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Zfp558E9Q1J0 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Zfp558E9Q1J0 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Zfp558E9Q1J0 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Zfp558E9Q1J0 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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Zfp558E9Q1J0 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zfp558E9Q1J0 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zfp558E9Q1J0 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zfp558E9Q1J0 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zfp558E9Q1J0 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zfp558E9Q1J0 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
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Zfp558E9Q1J0 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zfp558E9Q1J0 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
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Zfp558E9Q1J0 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zfp558E9Q1J0 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zfp558E9Q1J0 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zfp558E9Q1J0 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zfp558E9Q1J0 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zfp558E9Q1J0 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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Zfp558E9Q1J0 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zfp558E9Q1J0 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zfp558E9Q1J0 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zfp558E9Q1J0 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zfp558E9Q1J0 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
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Zfp558E9Q1J0 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zfp558E9Q1J0 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zfp558E9Q1J0 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zfp558E9Q1J0 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zfp558E9Q1J0 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zfp558E9Q1J0 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zfp558E9Q1J0 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zfp558E9Q1J0 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zfp558E9Q1J0 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Zfp558E9Q1J0 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zfp558E9Q1J0 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zfp558E9Q1J0 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zfp558E9Q1J0 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Zfp558E9Q1J0 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zfp558E9Q1J0 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zfp558E9Q1J0 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zfp558E9Q1J0 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zfp558E9Q1J0 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zfp558E9Q1J0 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zfp558E9Q1J0 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Zfp558E9Q1J0 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Zfp558E9Q1J0 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Zfp558E9Q1J0 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Zfp558E9Q1J0 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Zfp558E9Q1J0 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Zfp558E9Q1J0 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Zfp558E9Q1J0 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
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