Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ8

E430018J23Rik, RIKEN cDNA E430018J23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E430018J23RikE9PZQ8 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
E430018J23RikE9PZQ8 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
E430018J23RikE9PZQ8 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E430018J23RikE9PZQ8 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E430018J23RikE9PZQ8 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E430018J23RikE9PZQ8 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E430018J23RikE9PZQ8 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
E430018J23RikE9PZQ8 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
E430018J23RikE9PZQ8 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
E430018J23RikE9PZQ8 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E430018J23RikE9PZQ8 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E430018J23RikE9PZQ8 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
E430018J23RikE9PZQ8 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E430018J23RikE9PZQ8 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E430018J23RikE9PZQ8 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E430018J23RikE9PZQ8 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
E430018J23RikE9PZQ8 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
E430018J23RikE9PZQ8 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
E430018J23RikE9PZQ8 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
E430018J23RikE9PZQ8 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
E430018J23RikE9PZQ8 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
E430018J23RikE9PZQ8 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
E430018J23RikE9PZQ8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
E430018J23RikE9PZQ8 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
E430018J23RikE9PZQ8 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
E430018J23RikE9PZQ8 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
E430018J23RikE9PZQ8 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
E430018J23RikE9PZQ8 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E430018J23RikE9PZQ8 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E430018J23RikE9PZQ8 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E430018J23RikE9PZQ8 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
E430018J23RikE9PZQ8 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E430018J23RikE9PZQ8 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E430018J23RikE9PZQ8 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
E430018J23RikE9PZQ8 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E430018J23RikE9PZQ8 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
E430018J23RikE9PZQ8 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E430018J23RikE9PZQ8 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E430018J23RikE9PZQ8 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E430018J23RikE9PZQ8 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
E430018J23RikE9PZQ8 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E430018J23RikE9PZQ8 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
E430018J23RikE9PZQ8 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E430018J23RikE9PZQ8 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
E430018J23RikE9PZQ8 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
E430018J23RikE9PZQ8 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
E430018J23RikE9PZQ8 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
E430018J23RikE9PZQ8 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
E430018J23RikE9PZQ8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
E430018J23RikE9PZQ8 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
E430018J23RikE9PZQ8 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
E430018J23RikE9PZQ8 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
E430018J23RikE9PZQ8 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
E430018J23RikE9PZQ8 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
E430018J23RikE9PZQ8 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
E430018J23RikE9PZQ8 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
E430018J23RikE9PZQ8 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
E430018J23RikE9PZQ8 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
E430018J23RikE9PZQ8 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
E430018J23RikE9PZQ8 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
E430018J23RikE9PZQ8 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
E430018J23RikE9PZQ8 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
E430018J23RikE9PZQ8 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
E430018J23RikE9PZQ8 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
E430018J23RikE9PZQ8 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
E430018J23RikE9PZQ8 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
E430018J23RikE9PZQ8 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
E430018J23RikE9PZQ8 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
E430018J23RikE9PZQ8 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
E430018J23RikE9PZQ8 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
E430018J23RikE9PZQ8 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
E430018J23RikE9PZQ8 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
E430018J23RikE9PZQ8 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
E430018J23RikE9PZQ8 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
E430018J23RikE9PZQ8 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
E430018J23RikE9PZQ8 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
E430018J23RikE9PZQ8 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
E430018J23RikE9PZQ8 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
E430018J23RikE9PZQ8 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
E430018J23RikE9PZQ8 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
E430018J23RikE9PZQ8 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
E430018J23RikE9PZQ8 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
E430018J23RikE9PZQ8 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
E430018J23RikE9PZQ8 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
E430018J23RikE9PZQ8 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
E430018J23RikE9PZQ8 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
E430018J23RikE9PZQ8 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
E430018J23RikE9PZQ8 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
E430018J23RikE9PZQ8 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
E430018J23RikE9PZQ8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
E430018J23RikE9PZQ8 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
E430018J23RikE9PZQ8 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
E430018J23RikE9PZQ8 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
E430018J23RikE9PZQ8 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
E430018J23RikE9PZQ8 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
E430018J23RikE9PZQ8 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
E430018J23RikE9PZQ8 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
E430018J23RikE9PZQ8 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
E430018J23RikE9PZQ8 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
E430018J23RikE9PZQ8 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms