Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ54

Gcom1, GRINL1A complex locus, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcom1E9PZ54 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gcom1E9PZ54 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gcom1E9PZ54 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gcom1E9PZ54 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gcom1E9PZ54 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gcom1E9PZ54 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gcom1E9PZ54 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gcom1E9PZ54 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gcom1E9PZ54 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gcom1E9PZ54 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gcom1E9PZ54 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gcom1E9PZ54 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gcom1E9PZ54 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gcom1E9PZ54 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gcom1E9PZ54 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gcom1E9PZ54 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gcom1E9PZ54 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gcom1E9PZ54 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gcom1E9PZ54 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gcom1E9PZ54 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gcom1E9PZ54 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gcom1E9PZ54 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gcom1E9PZ54 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gcom1E9PZ54 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gcom1E9PZ54 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gcom1E9PZ54 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gcom1E9PZ54 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gcom1E9PZ54 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gcom1E9PZ54 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gcom1E9PZ54 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gcom1E9PZ54 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gcom1E9PZ54 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gcom1E9PZ54 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gcom1E9PZ54 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gcom1E9PZ54 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gcom1E9PZ54 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gcom1E9PZ54 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gcom1E9PZ54 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gcom1E9PZ54 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gcom1E9PZ54 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gcom1E9PZ54 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gcom1E9PZ54 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gcom1E9PZ54 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gcom1E9PZ54 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gcom1E9PZ54 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Gcom1E9PZ54 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gcom1E9PZ54 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gcom1E9PZ54 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gcom1E9PZ54 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gcom1E9PZ54 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gcom1E9PZ54 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gcom1E9PZ54 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Gcom1E9PZ54 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gcom1E9PZ54 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gcom1E9PZ54 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gcom1E9PZ54 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gcom1E9PZ54 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gcom1E9PZ54 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gcom1E9PZ54 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gcom1E9PZ54 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gcom1E9PZ54 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gcom1E9PZ54 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Gcom1E9PZ54 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gcom1E9PZ54 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gcom1E9PZ54 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gcom1E9PZ54 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gcom1E9PZ54 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gcom1E9PZ54 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gcom1E9PZ54 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gcom1E9PZ54 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gcom1E9PZ54 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gcom1E9PZ54 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gcom1E9PZ54 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gcom1E9PZ54 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gcom1E9PZ54 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gcom1E9PZ54 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gcom1E9PZ54 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gcom1E9PZ54 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gcom1E9PZ54 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gcom1E9PZ54 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gcom1E9PZ54 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gcom1E9PZ54 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gcom1E9PZ54 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gcom1E9PZ54 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gcom1E9PZ54 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gcom1E9PZ54 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gcom1E9PZ54 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gcom1E9PZ54 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gcom1E9PZ54 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gcom1E9PZ54 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gcom1E9PZ54 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gcom1E9PZ54 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gcom1E9PZ54 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gcom1E9PZ54 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gcom1E9PZ54 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gcom1E9PZ54 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gcom1E9PZ54 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gcom1E9PZ54 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gcom1E9PZ54 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gcom1E9PZ54 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms