Protein–RNA interactions for Protein: E9PV48

Ifit3b, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3B, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifit3bE9PV48 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ifit3bE9PV48 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ifit3bE9PV48 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ifit3bE9PV48 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ifit3bE9PV48 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ifit3bE9PV48 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ifit3bE9PV48 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ifit3bE9PV48 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ifit3bE9PV48 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ifit3bE9PV48 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ifit3bE9PV48 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ifit3bE9PV48 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ifit3bE9PV48 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ifit3bE9PV48 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ifit3bE9PV48 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ifit3bE9PV48 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ifit3bE9PV48 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ifit3bE9PV48 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ifit3bE9PV48 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ifit3bE9PV48 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ifit3bE9PV48 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ifit3bE9PV48 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ifit3bE9PV48 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ifit3bE9PV48 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ifit3bE9PV48 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ifit3bE9PV48 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ifit3bE9PV48 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ifit3bE9PV48 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ifit3bE9PV48 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ifit3bE9PV48 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ifit3bE9PV48 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ifit3bE9PV48 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ifit3bE9PV48 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ifit3bE9PV48 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ifit3bE9PV48 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ifit3bE9PV48 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ifit3bE9PV48 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ifit3bE9PV48 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ifit3bE9PV48 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ifit3bE9PV48 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ifit3bE9PV48 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ifit3bE9PV48 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ifit3bE9PV48 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ifit3bE9PV48 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ifit3bE9PV48 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ifit3bE9PV48 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ifit3bE9PV48 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ifit3bE9PV48 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ifit3bE9PV48 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ifit3bE9PV48 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ifit3bE9PV48 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ifit3bE9PV48 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ifit3bE9PV48 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ifit3bE9PV48 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ifit3bE9PV48 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ifit3bE9PV48 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ifit3bE9PV48 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ifit3bE9PV48 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ifit3bE9PV48 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ifit3bE9PV48 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ifit3bE9PV48 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ifit3bE9PV48 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ifit3bE9PV48 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ifit3bE9PV48 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ifit3bE9PV48 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ifit3bE9PV48 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ifit3bE9PV48 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ifit3bE9PV48 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ifit3bE9PV48 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ifit3bE9PV48 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ifit3bE9PV48 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ifit3bE9PV48 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ifit3bE9PV48 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ifit3bE9PV48 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ifit3bE9PV48 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ifit3bE9PV48 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ifit3bE9PV48 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ifit3bE9PV48 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ifit3bE9PV48 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ifit3bE9PV48 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ifit3bE9PV48 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ifit3bE9PV48 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ifit3bE9PV48 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ifit3bE9PV48 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ifit3bE9PV48 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ifit3bE9PV48 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ifit3bE9PV48 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ifit3bE9PV48 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ifit3bE9PV48 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ifit3bE9PV48 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ifit3bE9PV48 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ifit3bE9PV48 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ifit3bE9PV48 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ifit3bE9PV48 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ifit3bE9PV48 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ifit3bE9PV48 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ifit3bE9PV48 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ifit3bE9PV48 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ifit3bE9PV48 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ifit3bE9PV48 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms