Protein–RNA interactions for Protein: E9PUD6

Zscan18, Zinc finger and SCAN domain-containing 18, mousemouse

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan18E9PUD6 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Zscan18E9PUD6 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zscan18E9PUD6 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zscan18E9PUD6 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zscan18E9PUD6 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zscan18E9PUD6 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zscan18E9PUD6 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zscan18E9PUD6 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zscan18E9PUD6 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zscan18E9PUD6 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zscan18E9PUD6 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Zscan18E9PUD6 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zscan18E9PUD6 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Zscan18E9PUD6 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zscan18E9PUD6 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zscan18E9PUD6 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Zscan18E9PUD6 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Zscan18E9PUD6 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zscan18E9PUD6 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zscan18E9PUD6 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zscan18E9PUD6 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zscan18E9PUD6 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zscan18E9PUD6 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zscan18E9PUD6 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zscan18E9PUD6 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zscan18E9PUD6 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zscan18E9PUD6 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zscan18E9PUD6 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zscan18E9PUD6 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zscan18E9PUD6 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Zscan18E9PUD6 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zscan18E9PUD6 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zscan18E9PUD6 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zscan18E9PUD6 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zscan18E9PUD6 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zscan18E9PUD6 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zscan18E9PUD6 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zscan18E9PUD6 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zscan18E9PUD6 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zscan18E9PUD6 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zscan18E9PUD6 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zscan18E9PUD6 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zscan18E9PUD6 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zscan18E9PUD6 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zscan18E9PUD6 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zscan18E9PUD6 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zscan18E9PUD6 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zscan18E9PUD6 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zscan18E9PUD6 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zscan18E9PUD6 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zscan18E9PUD6 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zscan18E9PUD6 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zscan18E9PUD6 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zscan18E9PUD6 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zscan18E9PUD6 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zscan18E9PUD6 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zscan18E9PUD6 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zscan18E9PUD6 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zscan18E9PUD6 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zscan18E9PUD6 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zscan18E9PUD6 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zscan18E9PUD6 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zscan18E9PUD6 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zscan18E9PUD6 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zscan18E9PUD6 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zscan18E9PUD6 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zscan18E9PUD6 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zscan18E9PUD6 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zscan18E9PUD6 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zscan18E9PUD6 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zscan18E9PUD6 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zscan18E9PUD6 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zscan18E9PUD6 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zscan18E9PUD6 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zscan18E9PUD6 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zscan18E9PUD6 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zscan18E9PUD6 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zscan18E9PUD6 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zscan18E9PUD6 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zscan18E9PUD6 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zscan18E9PUD6 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zscan18E9PUD6 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zscan18E9PUD6 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zscan18E9PUD6 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zscan18E9PUD6 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zscan18E9PUD6 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zscan18E9PUD6 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zscan18E9PUD6 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zscan18E9PUD6 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zscan18E9PUD6 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zscan18E9PUD6 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zscan18E9PUD6 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zscan18E9PUD6 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zscan18E9PUD6 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zscan18E9PUD6 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zscan18E9PUD6 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zscan18E9PUD6 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zscan18E9PUD6 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zscan18E9PUD6 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zscan18E9PUD6 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms