Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vpreb3D3Z6J4 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vpreb3D3Z6J4 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vpreb3D3Z6J4 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vpreb3D3Z6J4 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Vpreb3D3Z6J4 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vpreb3D3Z6J4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vpreb3D3Z6J4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vpreb3D3Z6J4 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vpreb3D3Z6J4 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vpreb3D3Z6J4 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vpreb3D3Z6J4 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vpreb3D3Z6J4 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vpreb3D3Z6J4 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vpreb3D3Z6J4 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vpreb3D3Z6J4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vpreb3D3Z6J4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vpreb3D3Z6J4 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vpreb3D3Z6J4 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vpreb3D3Z6J4 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vpreb3D3Z6J4 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vpreb3D3Z6J4 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vpreb3D3Z6J4 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vpreb3D3Z6J4 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Vpreb3D3Z6J4 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vpreb3D3Z6J4 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vpreb3D3Z6J4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vpreb3D3Z6J4 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vpreb3D3Z6J4 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vpreb3D3Z6J4 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vpreb3D3Z6J4 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vpreb3D3Z6J4 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Vpreb3D3Z6J4 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Vpreb3D3Z6J4 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Vpreb3D3Z6J4 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Vpreb3D3Z6J4 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Vpreb3D3Z6J4 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Vpreb3D3Z6J4 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Vpreb3D3Z6J4 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Vpreb3D3Z6J4 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Vpreb3D3Z6J4 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Vpreb3D3Z6J4 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Vpreb3D3Z6J4 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Vpreb3D3Z6J4 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Vpreb3D3Z6J4 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Vpreb3D3Z6J4 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Vpreb3D3Z6J4 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Vpreb3D3Z6J4 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Vpreb3D3Z6J4 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Vpreb3D3Z6J4 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Vpreb3D3Z6J4 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Vpreb3D3Z6J4 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Vpreb3D3Z6J4 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Vpreb3D3Z6J4 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Vpreb3D3Z6J4 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Vpreb3D3Z6J4 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Vpreb3D3Z6J4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Vpreb3D3Z6J4 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Vpreb3D3Z6J4 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Vpreb3D3Z6J4 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Vpreb3D3Z6J4 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Vpreb3D3Z6J4 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Vpreb3D3Z6J4 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Vpreb3D3Z6J4 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Vpreb3D3Z6J4 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Vpreb3D3Z6J4 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Vpreb3D3Z6J4 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Vpreb3D3Z6J4 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Vpreb3D3Z6J4 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Vpreb3D3Z6J4 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Vpreb3D3Z6J4 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Vpreb3D3Z6J4 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Vpreb3D3Z6J4 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Vpreb3D3Z6J4 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Vpreb3D3Z6J4 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Vpreb3D3Z6J4 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Vpreb3D3Z6J4 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Vpreb3D3Z6J4 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Vpreb3D3Z6J4 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Vpreb3D3Z6J4 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Vpreb3D3Z6J4 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Vpreb3D3Z6J4 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Vpreb3D3Z6J4 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Vpreb3D3Z6J4 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Vpreb3D3Z6J4 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Vpreb3D3Z6J4 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Vpreb3D3Z6J4 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Vpreb3D3Z6J4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Vpreb3D3Z6J4 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Vpreb3D3Z6J4 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Vpreb3D3Z6J4 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Vpreb3D3Z6J4 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Vpreb3D3Z6J4 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Vpreb3D3Z6J4 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Vpreb3D3Z6J4 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Vpreb3D3Z6J4 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Vpreb3D3Z6J4 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Vpreb3D3Z6J4 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Vpreb3D3Z6J4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Vpreb3D3Z6J4 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms