Protein–RNA interactions for Protein: D3Z4U6

Gm5934, Predicted gene 5934, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5934D3Z4U6 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm5934D3Z4U6 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm5934D3Z4U6 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm5934D3Z4U6 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm5934D3Z4U6 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gm5934D3Z4U6 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gm5934D3Z4U6 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm5934D3Z4U6 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm5934D3Z4U6 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm5934D3Z4U6 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm5934D3Z4U6 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm5934D3Z4U6 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm5934D3Z4U6 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm5934D3Z4U6 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm5934D3Z4U6 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm5934D3Z4U6 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm5934D3Z4U6 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm5934D3Z4U6 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm5934D3Z4U6 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm5934D3Z4U6 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm5934D3Z4U6 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm5934D3Z4U6 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm5934D3Z4U6 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm5934D3Z4U6 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm5934D3Z4U6 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm5934D3Z4U6 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm5934D3Z4U6 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm5934D3Z4U6 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm5934D3Z4U6 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm5934D3Z4U6 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm5934D3Z4U6 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm5934D3Z4U6 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm5934D3Z4U6 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm5934D3Z4U6 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm5934D3Z4U6 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm5934D3Z4U6 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm5934D3Z4U6 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm5934D3Z4U6 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm5934D3Z4U6 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm5934D3Z4U6 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm5934D3Z4U6 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm5934D3Z4U6 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm5934D3Z4U6 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm5934D3Z4U6 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm5934D3Z4U6 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm5934D3Z4U6 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm5934D3Z4U6 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm5934D3Z4U6 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm5934D3Z4U6 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm5934D3Z4U6 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm5934D3Z4U6 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gm5934D3Z4U6 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gm5934D3Z4U6 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm5934D3Z4U6 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm5934D3Z4U6 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm5934D3Z4U6 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm5934D3Z4U6 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gm5934D3Z4U6 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm5934D3Z4U6 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm5934D3Z4U6 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm5934D3Z4U6 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm5934D3Z4U6 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm5934D3Z4U6 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Gm5934D3Z4U6 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm5934D3Z4U6 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Gm5934D3Z4U6 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm5934D3Z4U6 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.31■■□□□ 1
Gm5934D3Z4U6 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Gm5934D3Z4U6 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Gm5934D3Z4U6 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm5934D3Z4U6 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm5934D3Z4U6 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm5934D3Z4U6 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm5934D3Z4U6 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm5934D3Z4U6 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gm5934D3Z4U6 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm5934D3Z4U6 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm5934D3Z4U6 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gm5934D3Z4U6 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm5934D3Z4U6 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm5934D3Z4U6 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm5934D3Z4U6 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Gm5934D3Z4U6 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm5934D3Z4U6 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm5934D3Z4U6 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Gm5934D3Z4U6 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gm5934D3Z4U6 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gm5934D3Z4U6 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gm5934D3Z4U6 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Gm5934D3Z4U6 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm5934D3Z4U6 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gm5934D3Z4U6 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gm5934D3Z4U6 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm5934D3Z4U6 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm5934D3Z4U6 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm5934D3Z4U6 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm5934D3Z4U6 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm5934D3Z4U6 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Gm5934D3Z4U6 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Gm5934D3Z4U6 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms