Protein–RNA interactions for Protein: D3Z4D4

1700064H15Rik, RIKEN cDNA 1700064H15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700064H15RikD3Z4D4 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
1700064H15RikD3Z4D4 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
1700064H15RikD3Z4D4 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
1700064H15RikD3Z4D4 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
1700064H15RikD3Z4D4 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
1700064H15RikD3Z4D4 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
1700064H15RikD3Z4D4 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
1700064H15RikD3Z4D4 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
1700064H15RikD3Z4D4 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
1700064H15RikD3Z4D4 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
1700064H15RikD3Z4D4 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
1700064H15RikD3Z4D4 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
1700064H15RikD3Z4D4 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
1700064H15RikD3Z4D4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
1700064H15RikD3Z4D4 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
1700064H15RikD3Z4D4 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
1700064H15RikD3Z4D4 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
1700064H15RikD3Z4D4 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
1700064H15RikD3Z4D4 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
1700064H15RikD3Z4D4 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
1700064H15RikD3Z4D4 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
1700064H15RikD3Z4D4 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
1700064H15RikD3Z4D4 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
1700064H15RikD3Z4D4 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
1700064H15RikD3Z4D4 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
1700064H15RikD3Z4D4 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
1700064H15RikD3Z4D4 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
1700064H15RikD3Z4D4 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
1700064H15RikD3Z4D4 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
1700064H15RikD3Z4D4 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
1700064H15RikD3Z4D4 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
1700064H15RikD3Z4D4 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
1700064H15RikD3Z4D4 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
1700064H15RikD3Z4D4 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
1700064H15RikD3Z4D4 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
1700064H15RikD3Z4D4 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
1700064H15RikD3Z4D4 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
1700064H15RikD3Z4D4 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
1700064H15RikD3Z4D4 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
1700064H15RikD3Z4D4 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
1700064H15RikD3Z4D4 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
1700064H15RikD3Z4D4 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
1700064H15RikD3Z4D4 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
1700064H15RikD3Z4D4 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
1700064H15RikD3Z4D4 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
1700064H15RikD3Z4D4 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
1700064H15RikD3Z4D4 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
1700064H15RikD3Z4D4 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
1700064H15RikD3Z4D4 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
1700064H15RikD3Z4D4 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
1700064H15RikD3Z4D4 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
1700064H15RikD3Z4D4 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
1700064H15RikD3Z4D4 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
1700064H15RikD3Z4D4 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
1700064H15RikD3Z4D4 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
1700064H15RikD3Z4D4 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
1700064H15RikD3Z4D4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
1700064H15RikD3Z4D4 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
1700064H15RikD3Z4D4 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
1700064H15RikD3Z4D4 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
1700064H15RikD3Z4D4 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
1700064H15RikD3Z4D4 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
1700064H15RikD3Z4D4 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
1700064H15RikD3Z4D4 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
1700064H15RikD3Z4D4 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
1700064H15RikD3Z4D4 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
1700064H15RikD3Z4D4 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
1700064H15RikD3Z4D4 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
1700064H15RikD3Z4D4 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
1700064H15RikD3Z4D4 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
1700064H15RikD3Z4D4 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
1700064H15RikD3Z4D4 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
1700064H15RikD3Z4D4 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
1700064H15RikD3Z4D4 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
1700064H15RikD3Z4D4 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
1700064H15RikD3Z4D4 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
1700064H15RikD3Z4D4 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
1700064H15RikD3Z4D4 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
1700064H15RikD3Z4D4 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
1700064H15RikD3Z4D4 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
1700064H15RikD3Z4D4 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
1700064H15RikD3Z4D4 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
1700064H15RikD3Z4D4 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
1700064H15RikD3Z4D4 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
1700064H15RikD3Z4D4 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
1700064H15RikD3Z4D4 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
1700064H15RikD3Z4D4 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
1700064H15RikD3Z4D4 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
1700064H15RikD3Z4D4 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
1700064H15RikD3Z4D4 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
1700064H15RikD3Z4D4 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
1700064H15RikD3Z4D4 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
1700064H15RikD3Z4D4 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
1700064H15RikD3Z4D4 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
1700064H15RikD3Z4D4 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
1700064H15RikD3Z4D4 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
1700064H15RikD3Z4D4 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
1700064H15RikD3Z4D4 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
1700064H15RikD3Z4D4 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
1700064H15RikD3Z4D4 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms