Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc170D3YXL0 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc170D3YXL0 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc170D3YXL0 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc170D3YXL0 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc170D3YXL0 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc170D3YXL0 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc170D3YXL0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc170D3YXL0 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc170D3YXL0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc170D3YXL0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc170D3YXL0 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc170D3YXL0 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc170D3YXL0 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc170D3YXL0 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc170D3YXL0 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc170D3YXL0 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc170D3YXL0 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc170D3YXL0 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc170D3YXL0 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc170D3YXL0 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc170D3YXL0 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc170D3YXL0 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc170D3YXL0 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc170D3YXL0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc170D3YXL0 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc170D3YXL0 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc170D3YXL0 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc170D3YXL0 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc170D3YXL0 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc170D3YXL0 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc170D3YXL0 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc170D3YXL0 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc170D3YXL0 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc170D3YXL0 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc170D3YXL0 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc170D3YXL0 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc170D3YXL0 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc170D3YXL0 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc170D3YXL0 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc170D3YXL0 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc170D3YXL0 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc170D3YXL0 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc170D3YXL0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc170D3YXL0 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc170D3YXL0 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc170D3YXL0 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc170D3YXL0 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc170D3YXL0 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc170D3YXL0 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc170D3YXL0 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc170D3YXL0 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc170D3YXL0 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc170D3YXL0 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc170D3YXL0 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc170D3YXL0 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc170D3YXL0 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc170D3YXL0 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc170D3YXL0 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc170D3YXL0 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc170D3YXL0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc170D3YXL0 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc170D3YXL0 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc170D3YXL0 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc170D3YXL0 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc170D3YXL0 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc170D3YXL0 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc170D3YXL0 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc170D3YXL0 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc170D3YXL0 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc170D3YXL0 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc170D3YXL0 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc170D3YXL0 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc170D3YXL0 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc170D3YXL0 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc170D3YXL0 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc170D3YXL0 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc170D3YXL0 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc170D3YXL0 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc170D3YXL0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc170D3YXL0 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc170D3YXL0 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc170D3YXL0 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc170D3YXL0 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc170D3YXL0 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc170D3YXL0 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc170D3YXL0 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc170D3YXL0 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc170D3YXL0 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc170D3YXL0 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc170D3YXL0 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc170D3YXL0 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc170D3YXL0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc170D3YXL0 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc170D3YXL0 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc170D3YXL0 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc170D3YXL0 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc170D3YXL0 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc170D3YXL0 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc170D3YXL0 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms