Protein–RNA interactions for Protein: B9EKR1

Ptprz1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, mousemouse

Predictions only

Length 2,312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprz1B9EKR1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ptprz1B9EKR1 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ptprz1B9EKR1 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ptprz1B9EKR1 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ptprz1B9EKR1 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ptprz1B9EKR1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ptprz1B9EKR1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ptprz1B9EKR1 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ptprz1B9EKR1 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ptprz1B9EKR1 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ptprz1B9EKR1 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ptprz1B9EKR1 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ptprz1B9EKR1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ptprz1B9EKR1 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ptprz1B9EKR1 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ptprz1B9EKR1 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ptprz1B9EKR1 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ptprz1B9EKR1 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ptprz1B9EKR1 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ptprz1B9EKR1 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ptprz1B9EKR1 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ptprz1B9EKR1 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ptprz1B9EKR1 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ptprz1B9EKR1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ptprz1B9EKR1 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ptprz1B9EKR1 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ptprz1B9EKR1 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ptprz1B9EKR1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ptprz1B9EKR1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ptprz1B9EKR1 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ptprz1B9EKR1 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ptprz1B9EKR1 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ptprz1B9EKR1 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ptprz1B9EKR1 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ptprz1B9EKR1 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ptprz1B9EKR1 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ptprz1B9EKR1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ptprz1B9EKR1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ptprz1B9EKR1 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ptprz1B9EKR1 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ptprz1B9EKR1 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ptprz1B9EKR1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ptprz1B9EKR1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ptprz1B9EKR1 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ptprz1B9EKR1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ptprz1B9EKR1 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ptprz1B9EKR1 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ptprz1B9EKR1 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ptprz1B9EKR1 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ptprz1B9EKR1 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ptprz1B9EKR1 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ptprz1B9EKR1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ptprz1B9EKR1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ptprz1B9EKR1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ptprz1B9EKR1 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ptprz1B9EKR1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ptprz1B9EKR1 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ptprz1B9EKR1 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ptprz1B9EKR1 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ptprz1B9EKR1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ptprz1B9EKR1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ptprz1B9EKR1 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ptprz1B9EKR1 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ptprz1B9EKR1 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ptprz1B9EKR1 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ptprz1B9EKR1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ptprz1B9EKR1 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ptprz1B9EKR1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ptprz1B9EKR1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ptprz1B9EKR1 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ptprz1B9EKR1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ptprz1B9EKR1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ptprz1B9EKR1 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ptprz1B9EKR1 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ptprz1B9EKR1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ptprz1B9EKR1 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ptprz1B9EKR1 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ptprz1B9EKR1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ptprz1B9EKR1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ptprz1B9EKR1 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ptprz1B9EKR1 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ptprz1B9EKR1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ptprz1B9EKR1 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ptprz1B9EKR1 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ptprz1B9EKR1 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ptprz1B9EKR1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ptprz1B9EKR1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ptprz1B9EKR1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ptprz1B9EKR1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ptprz1B9EKR1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ptprz1B9EKR1 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ptprz1B9EKR1 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ptprz1B9EKR1 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ptprz1B9EKR1 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ptprz1B9EKR1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ptprz1B9EKR1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ptprz1B9EKR1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ptprz1B9EKR1 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ptprz1B9EKR1 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ptprz1B9EKR1 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms