Protein–RNA interactions for Protein: B9EJ80

Pdzd8, PDZ domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd8B9EJ80 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdzd8B9EJ80 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdzd8B9EJ80 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdzd8B9EJ80 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdzd8B9EJ80 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdzd8B9EJ80 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdzd8B9EJ80 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdzd8B9EJ80 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdzd8B9EJ80 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdzd8B9EJ80 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdzd8B9EJ80 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdzd8B9EJ80 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdzd8B9EJ80 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdzd8B9EJ80 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdzd8B9EJ80 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdzd8B9EJ80 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdzd8B9EJ80 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pdzd8B9EJ80 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pdzd8B9EJ80 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pdzd8B9EJ80 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pdzd8B9EJ80 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pdzd8B9EJ80 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pdzd8B9EJ80 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pdzd8B9EJ80 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Pdzd8B9EJ80 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pdzd8B9EJ80 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pdzd8B9EJ80 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pdzd8B9EJ80 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pdzd8B9EJ80 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pdzd8B9EJ80 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Pdzd8B9EJ80 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pdzd8B9EJ80 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pdzd8B9EJ80 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pdzd8B9EJ80 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pdzd8B9EJ80 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pdzd8B9EJ80 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pdzd8B9EJ80 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pdzd8B9EJ80 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pdzd8B9EJ80 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pdzd8B9EJ80 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pdzd8B9EJ80 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pdzd8B9EJ80 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pdzd8B9EJ80 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pdzd8B9EJ80 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pdzd8B9EJ80 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pdzd8B9EJ80 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pdzd8B9EJ80 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pdzd8B9EJ80 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pdzd8B9EJ80 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Pdzd8B9EJ80 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pdzd8B9EJ80 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pdzd8B9EJ80 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pdzd8B9EJ80 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pdzd8B9EJ80 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pdzd8B9EJ80 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pdzd8B9EJ80 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pdzd8B9EJ80 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pdzd8B9EJ80 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pdzd8B9EJ80 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pdzd8B9EJ80 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Pdzd8B9EJ80 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdzd8B9EJ80 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdzd8B9EJ80 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdzd8B9EJ80 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdzd8B9EJ80 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdzd8B9EJ80 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdzd8B9EJ80 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdzd8B9EJ80 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdzd8B9EJ80 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdzd8B9EJ80 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdzd8B9EJ80 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdzd8B9EJ80 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdzd8B9EJ80 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdzd8B9EJ80 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdzd8B9EJ80 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdzd8B9EJ80 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdzd8B9EJ80 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdzd8B9EJ80 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdzd8B9EJ80 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdzd8B9EJ80 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdzd8B9EJ80 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdzd8B9EJ80 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdzd8B9EJ80 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdzd8B9EJ80 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdzd8B9EJ80 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdzd8B9EJ80 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdzd8B9EJ80 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdzd8B9EJ80 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdzd8B9EJ80 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdzd8B9EJ80 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdzd8B9EJ80 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdzd8B9EJ80 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdzd8B9EJ80 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdzd8B9EJ80 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdzd8B9EJ80 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdzd8B9EJ80 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdzd8B9EJ80 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdzd8B9EJ80 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdzd8B9EJ80 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdzd8B9EJ80 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms