Protein–RNA interactions for Protein: B2RXC1

Trappc11, Trafficking protein particle complex subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc11B2RXC1 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trappc11B2RXC1 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trappc11B2RXC1 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trappc11B2RXC1 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trappc11B2RXC1 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trappc11B2RXC1 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trappc11B2RXC1 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trappc11B2RXC1 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trappc11B2RXC1 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trappc11B2RXC1 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trappc11B2RXC1 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trappc11B2RXC1 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trappc11B2RXC1 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trappc11B2RXC1 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trappc11B2RXC1 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trappc11B2RXC1 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Trappc11B2RXC1 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trappc11B2RXC1 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trappc11B2RXC1 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trappc11B2RXC1 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trappc11B2RXC1 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trappc11B2RXC1 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trappc11B2RXC1 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trappc11B2RXC1 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trappc11B2RXC1 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trappc11B2RXC1 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trappc11B2RXC1 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trappc11B2RXC1 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trappc11B2RXC1 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trappc11B2RXC1 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trappc11B2RXC1 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trappc11B2RXC1 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trappc11B2RXC1 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trappc11B2RXC1 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trappc11B2RXC1 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trappc11B2RXC1 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trappc11B2RXC1 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trappc11B2RXC1 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trappc11B2RXC1 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trappc11B2RXC1 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trappc11B2RXC1 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trappc11B2RXC1 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trappc11B2RXC1 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trappc11B2RXC1 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trappc11B2RXC1 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trappc11B2RXC1 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trappc11B2RXC1 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trappc11B2RXC1 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trappc11B2RXC1 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trappc11B2RXC1 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trappc11B2RXC1 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trappc11B2RXC1 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trappc11B2RXC1 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trappc11B2RXC1 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trappc11B2RXC1 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trappc11B2RXC1 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trappc11B2RXC1 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trappc11B2RXC1 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trappc11B2RXC1 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trappc11B2RXC1 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trappc11B2RXC1 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trappc11B2RXC1 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trappc11B2RXC1 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trappc11B2RXC1 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trappc11B2RXC1 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trappc11B2RXC1 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trappc11B2RXC1 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trappc11B2RXC1 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trappc11B2RXC1 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trappc11B2RXC1 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trappc11B2RXC1 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trappc11B2RXC1 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trappc11B2RXC1 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trappc11B2RXC1 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trappc11B2RXC1 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trappc11B2RXC1 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trappc11B2RXC1 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trappc11B2RXC1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trappc11B2RXC1 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trappc11B2RXC1 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Trappc11B2RXC1 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trappc11B2RXC1 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trappc11B2RXC1 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trappc11B2RXC1 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trappc11B2RXC1 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trappc11B2RXC1 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trappc11B2RXC1 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trappc11B2RXC1 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trappc11B2RXC1 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trappc11B2RXC1 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trappc11B2RXC1 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trappc11B2RXC1 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trappc11B2RXC1 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Trappc11B2RXC1 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Trappc11B2RXC1 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trappc11B2RXC1 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trappc11B2RXC1 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trappc11B2RXC1 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trappc11B2RXC1 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Trappc11B2RXC1 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms