Protein–RNA interactions for Protein: B2RVB7

Hbb-bh2, Globin b2, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hbb-bh2B2RVB7 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hbb-bh2B2RVB7 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hbb-bh2B2RVB7 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hbb-bh2B2RVB7 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hbb-bh2B2RVB7 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hbb-bh2B2RVB7 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hbb-bh2B2RVB7 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hbb-bh2B2RVB7 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hbb-bh2B2RVB7 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hbb-bh2B2RVB7 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hbb-bh2B2RVB7 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hbb-bh2B2RVB7 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hbb-bh2B2RVB7 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hbb-bh2B2RVB7 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hbb-bh2B2RVB7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hbb-bh2B2RVB7 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hbb-bh2B2RVB7 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hbb-bh2B2RVB7 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hbb-bh2B2RVB7 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hbb-bh2B2RVB7 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hbb-bh2B2RVB7 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hbb-bh2B2RVB7 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hbb-bh2B2RVB7 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hbb-bh2B2RVB7 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hbb-bh2B2RVB7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hbb-bh2B2RVB7 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Hbb-bh2B2RVB7 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hbb-bh2B2RVB7 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hbb-bh2B2RVB7 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hbb-bh2B2RVB7 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hbb-bh2B2RVB7 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hbb-bh2B2RVB7 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hbb-bh2B2RVB7 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hbb-bh2B2RVB7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hbb-bh2B2RVB7 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hbb-bh2B2RVB7 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hbb-bh2B2RVB7 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hbb-bh2B2RVB7 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hbb-bh2B2RVB7 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hbb-bh2B2RVB7 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hbb-bh2B2RVB7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hbb-bh2B2RVB7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hbb-bh2B2RVB7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hbb-bh2B2RVB7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hbb-bh2B2RVB7 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hbb-bh2B2RVB7 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hbb-bh2B2RVB7 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hbb-bh2B2RVB7 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hbb-bh2B2RVB7 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hbb-bh2B2RVB7 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hbb-bh2B2RVB7 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hbb-bh2B2RVB7 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hbb-bh2B2RVB7 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hbb-bh2B2RVB7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hbb-bh2B2RVB7 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hbb-bh2B2RVB7 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hbb-bh2B2RVB7 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hbb-bh2B2RVB7 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hbb-bh2B2RVB7 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hbb-bh2B2RVB7 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hbb-bh2B2RVB7 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hbb-bh2B2RVB7 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hbb-bh2B2RVB7 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hbb-bh2B2RVB7 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hbb-bh2B2RVB7 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hbb-bh2B2RVB7 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hbb-bh2B2RVB7 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hbb-bh2B2RVB7 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hbb-bh2B2RVB7 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hbb-bh2B2RVB7 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hbb-bh2B2RVB7 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hbb-bh2B2RVB7 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hbb-bh2B2RVB7 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hbb-bh2B2RVB7 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hbb-bh2B2RVB7 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hbb-bh2B2RVB7 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hbb-bh2B2RVB7 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hbb-bh2B2RVB7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hbb-bh2B2RVB7 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hbb-bh2B2RVB7 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hbb-bh2B2RVB7 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hbb-bh2B2RVB7 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hbb-bh2B2RVB7 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hbb-bh2B2RVB7 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hbb-bh2B2RVB7 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hbb-bh2B2RVB7 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hbb-bh2B2RVB7 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hbb-bh2B2RVB7 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hbb-bh2B2RVB7 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Hbb-bh2B2RVB7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hbb-bh2B2RVB7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hbb-bh2B2RVB7 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hbb-bh2B2RVB7 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hbb-bh2B2RVB7 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hbb-bh2B2RVB7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hbb-bh2B2RVB7 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hbb-bh2B2RVB7 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Hbb-bh2B2RVB7 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hbb-bh2B2RVB7 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hbb-bh2B2RVB7 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms