Protein–RNA interactions for Protein: B2RUS7

Abcc8, ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc8B2RUS7 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.88■■■■□ 3.98
Abcc8B2RUS7 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.98
Abcc8B2RUS7 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC39.88■■■■□ 3.97
Abcc8B2RUS7 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC39.88■■■■□ 3.97
Abcc8B2RUS7 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
Abcc8B2RUS7 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
Abcc8B2RUS7 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC39.88■■■■□ 3.97
Abcc8B2RUS7 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC39.87■■■■□ 3.97
Abcc8B2RUS7 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
Abcc8B2RUS7 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
Abcc8B2RUS7 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC39.87■■■■□ 3.97
Abcc8B2RUS7 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
Abcc8B2RUS7 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
Abcc8B2RUS7 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC39.86■■■■□ 3.97
Abcc8B2RUS7 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
Abcc8B2RUS7 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
Abcc8B2RUS7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
Abcc8B2RUS7 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC39.85■■■■□ 3.97
Abcc8B2RUS7 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.84■■■■□ 3.97
Abcc8B2RUS7 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC39.84■■■■□ 3.97
Abcc8B2RUS7 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
Abcc8B2RUS7 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
Abcc8B2RUS7 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
Abcc8B2RUS7 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC39.84■■■■□ 3.97
Abcc8B2RUS7 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
Abcc8B2RUS7 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
Abcc8B2RUS7 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
Abcc8B2RUS7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
Abcc8B2RUS7 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.97
Abcc8B2RUS7 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC39.82■■■■□ 3.97
Abcc8B2RUS7 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.96
Abcc8B2RUS7 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.96
Abcc8B2RUS7 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
Abcc8B2RUS7 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
Abcc8B2RUS7 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
Abcc8B2RUS7 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
Abcc8B2RUS7 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC39.8■■■■□ 3.96
Abcc8B2RUS7 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC39.8■■■■□ 3.96
Abcc8B2RUS7 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
Abcc8B2RUS7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC39.8■■■■□ 3.96
Abcc8B2RUS7 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
Abcc8B2RUS7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
Abcc8B2RUS7 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC39.8■■■■□ 3.96
Abcc8B2RUS7 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC39.8■■■■□ 3.96
Abcc8B2RUS7 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC39.8■■■■□ 3.96
Abcc8B2RUS7 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
Abcc8B2RUS7 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
Abcc8B2RUS7 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
Abcc8B2RUS7 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC39.79■■■■□ 3.96
Abcc8B2RUS7 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC39.78■■■■□ 3.96
Abcc8B2RUS7 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.78■■■■□ 3.96
Abcc8B2RUS7 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC39.78■■■■□ 3.96
Abcc8B2RUS7 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.77■■■■□ 3.96
Abcc8B2RUS7 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
Abcc8B2RUS7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
Abcc8B2RUS7 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.96
Abcc8B2RUS7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.76■■■■□ 3.95
Abcc8B2RUS7 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.76■■■■□ 3.95
Abcc8B2RUS7 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC39.76■■■■□ 3.95
Abcc8B2RUS7 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
Abcc8B2RUS7 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
Abcc8B2RUS7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
Abcc8B2RUS7 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.75■■■■□ 3.95
Abcc8B2RUS7 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
Abcc8B2RUS7 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
Abcc8B2RUS7 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC39.74■■■■□ 3.95
Abcc8B2RUS7 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC39.74■■■■□ 3.95
Abcc8B2RUS7 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC39.74■■■■□ 3.95
Abcc8B2RUS7 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
Abcc8B2RUS7 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.73■■■■□ 3.95
Abcc8B2RUS7 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC39.73■■■■□ 3.95
Abcc8B2RUS7 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
Abcc8B2RUS7 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
Abcc8B2RUS7 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.73■■■■□ 3.95
Abcc8B2RUS7 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
Abcc8B2RUS7 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
Abcc8B2RUS7 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
Abcc8B2RUS7 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
Abcc8B2RUS7 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
Abcc8B2RUS7 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC39.72■■■■□ 3.95
Abcc8B2RUS7 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC39.72■■■■□ 3.95
Abcc8B2RUS7 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC39.71■■■■□ 3.95
Abcc8B2RUS7 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC39.71■■■■□ 3.95
Abcc8B2RUS7 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC39.71■■■■□ 3.95
Abcc8B2RUS7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.71■■■■□ 3.95
Abcc8B2RUS7 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
Abcc8B2RUS7 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC39.7■■■■□ 3.95
Abcc8B2RUS7 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
Abcc8B2RUS7 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.69■■■■□ 3.94
Abcc8B2RUS7 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC39.69■■■■□ 3.94
Abcc8B2RUS7 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
Abcc8B2RUS7 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
Abcc8B2RUS7 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.68■■■■□ 3.94
Abcc8B2RUS7 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
Abcc8B2RUS7 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
Abcc8B2RUS7 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
Abcc8B2RUS7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.68■■■■□ 3.94
Abcc8B2RUS7 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC39.67■■■■□ 3.94
Abcc8B2RUS7 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
Abcc8B2RUS7 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.67■■■■□ 3.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms