Protein–RNA interactions for Protein: B2RUM3

AU015836, AU015836 protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU015836B2RUM3 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AU015836B2RUM3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AU015836B2RUM3 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AU015836B2RUM3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AU015836B2RUM3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AU015836B2RUM3 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AU015836B2RUM3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AU015836B2RUM3 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AU015836B2RUM3 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AU015836B2RUM3 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AU015836B2RUM3 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AU015836B2RUM3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AU015836B2RUM3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AU015836B2RUM3 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AU015836B2RUM3 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AU015836B2RUM3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AU015836B2RUM3 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AU015836B2RUM3 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AU015836B2RUM3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AU015836B2RUM3 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
AU015836B2RUM3 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
AU015836B2RUM3 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
AU015836B2RUM3 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AU015836B2RUM3 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
AU015836B2RUM3 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
AU015836B2RUM3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
AU015836B2RUM3 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AU015836B2RUM3 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AU015836B2RUM3 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AU015836B2RUM3 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AU015836B2RUM3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AU015836B2RUM3 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AU015836B2RUM3 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
AU015836B2RUM3 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AU015836B2RUM3 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AU015836B2RUM3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AU015836B2RUM3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AU015836B2RUM3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AU015836B2RUM3 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AU015836B2RUM3 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AU015836B2RUM3 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AU015836B2RUM3 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AU015836B2RUM3 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AU015836B2RUM3 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AU015836B2RUM3 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AU015836B2RUM3 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AU015836B2RUM3 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AU015836B2RUM3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AU015836B2RUM3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AU015836B2RUM3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AU015836B2RUM3 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AU015836B2RUM3 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AU015836B2RUM3 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AU015836B2RUM3 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AU015836B2RUM3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AU015836B2RUM3 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AU015836B2RUM3 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AU015836B2RUM3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AU015836B2RUM3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AU015836B2RUM3 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
AU015836B2RUM3 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AU015836B2RUM3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AU015836B2RUM3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
AU015836B2RUM3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AU015836B2RUM3 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AU015836B2RUM3 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AU015836B2RUM3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
AU015836B2RUM3 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
AU015836B2RUM3 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AU015836B2RUM3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AU015836B2RUM3 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AU015836B2RUM3 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AU015836B2RUM3 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AU015836B2RUM3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
AU015836B2RUM3 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AU015836B2RUM3 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
AU015836B2RUM3 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AU015836B2RUM3 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
AU015836B2RUM3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AU015836B2RUM3 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
AU015836B2RUM3 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AU015836B2RUM3 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AU015836B2RUM3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AU015836B2RUM3 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AU015836B2RUM3 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AU015836B2RUM3 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AU015836B2RUM3 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AU015836B2RUM3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AU015836B2RUM3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AU015836B2RUM3 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AU015836B2RUM3 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AU015836B2RUM3 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AU015836B2RUM3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AU015836B2RUM3 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AU015836B2RUM3 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AU015836B2RUM3 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AU015836B2RUM3 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AU015836B2RUM3 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AU015836B2RUM3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AU015836B2RUM3 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms