Protein–RNA interactions for Protein: B2RT54

Apol7a, Apolipoprotein L 7a, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7aB2RT54 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Apol7aB2RT54 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Apol7aB2RT54 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Apol7aB2RT54 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Apol7aB2RT54 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Apol7aB2RT54 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Apol7aB2RT54 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Apol7aB2RT54 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Apol7aB2RT54 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Apol7aB2RT54 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Apol7aB2RT54 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Apol7aB2RT54 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Apol7aB2RT54 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Apol7aB2RT54 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Apol7aB2RT54 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Apol7aB2RT54 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Apol7aB2RT54 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Apol7aB2RT54 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Apol7aB2RT54 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Apol7aB2RT54 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Apol7aB2RT54 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Apol7aB2RT54 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Apol7aB2RT54 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Apol7aB2RT54 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Apol7aB2RT54 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Apol7aB2RT54 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Apol7aB2RT54 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Apol7aB2RT54 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Apol7aB2RT54 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Apol7aB2RT54 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Apol7aB2RT54 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Apol7aB2RT54 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Apol7aB2RT54 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Apol7aB2RT54 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Apol7aB2RT54 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Apol7aB2RT54 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Apol7aB2RT54 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Apol7aB2RT54 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Apol7aB2RT54 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Apol7aB2RT54 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Apol7aB2RT54 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Apol7aB2RT54 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Apol7aB2RT54 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Apol7aB2RT54 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Apol7aB2RT54 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Apol7aB2RT54 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Apol7aB2RT54 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Apol7aB2RT54 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Apol7aB2RT54 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Apol7aB2RT54 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Apol7aB2RT54 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Apol7aB2RT54 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Apol7aB2RT54 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Apol7aB2RT54 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Apol7aB2RT54 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Apol7aB2RT54 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Apol7aB2RT54 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Apol7aB2RT54 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Apol7aB2RT54 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Apol7aB2RT54 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Apol7aB2RT54 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Apol7aB2RT54 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Apol7aB2RT54 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Apol7aB2RT54 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Apol7aB2RT54 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Apol7aB2RT54 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Apol7aB2RT54 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Apol7aB2RT54 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Apol7aB2RT54 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Apol7aB2RT54 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Apol7aB2RT54 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Apol7aB2RT54 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Apol7aB2RT54 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Apol7aB2RT54 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Apol7aB2RT54 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Apol7aB2RT54 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Apol7aB2RT54 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Apol7aB2RT54 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Apol7aB2RT54 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Apol7aB2RT54 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Apol7aB2RT54 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Apol7aB2RT54 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Apol7aB2RT54 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Apol7aB2RT54 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Apol7aB2RT54 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Apol7aB2RT54 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Apol7aB2RT54 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Apol7aB2RT54 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Apol7aB2RT54 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Apol7aB2RT54 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Apol7aB2RT54 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Apol7aB2RT54 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Apol7aB2RT54 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Apol7aB2RT54 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Apol7aB2RT54 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Apol7aB2RT54 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Apol7aB2RT54 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Apol7aB2RT54 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Apol7aB2RT54 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Apol7aB2RT54 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms